Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT13P13646 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT13P13646 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT13P13646 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT13P13646 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT13P13646 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT13P13646 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT13P13646 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT13P13646 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT13P13646 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT13P13646 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT13P13646 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT13P13646 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT13P13646 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT13P13646 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT13P13646 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT13P13646 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT13P13646 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT13P13646 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT13P13646 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT13P13646 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT13P13646 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT13P13646 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT13P13646 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT13P13646 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT13P13646 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT13P13646 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT13P13646 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
KRT13P13646 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KRT13P13646 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT13P13646 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT13P13646 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT13P13646 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT13P13646 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT13P13646 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT13P13646 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT13P13646 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT13P13646 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT13P13646 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT13P13646 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT13P13646 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT13P13646 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT13P13646 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT13P13646 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT13P13646 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT13P13646 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT13P13646 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT13P13646 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT13P13646 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT13P13646 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT13P13646 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT13P13646 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT13P13646 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT13P13646 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT13P13646 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT13P13646 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT13P13646 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT13P13646 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT13P13646 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT13P13646 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT13P13646 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT13P13646 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT13P13646 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT13P13646 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT13P13646 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT13P13646 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT13P13646 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT13P13646 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT13P13646 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT13P13646 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT13P13646 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT13P13646 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRT13P13646 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT13P13646 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT13P13646 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT13P13646 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT13P13646 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT13P13646 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT13P13646 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT13P13646 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT13P13646 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT13P13646 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT13P13646 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT13P13646 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT13P13646 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT13P13646 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT13P13646 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT13P13646 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT13P13646 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT13P13646 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT13P13646 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT13P13646 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT13P13646 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT13P13646 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT13P13646 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT13P13646 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT13P13646 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT13P13646 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT13P13646 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT13P13646 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms