Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ACTN1P12814 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ACTN1P12814 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ACTN1P12814 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ACTN1P12814 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ACTN1P12814 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ACTN1P12814 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACTN1P12814 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACTN1P12814 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ACTN1P12814 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACTN1P12814 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACTN1P12814 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACTN1P12814 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACTN1P12814 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ACTN1P12814 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ACTN1P12814 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ACTN1P12814 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ACTN1P12814 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ACTN1P12814 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ACTN1P12814 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACTN1P12814 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACTN1P12814 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACTN1P12814 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACTN1P12814 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACTN1P12814 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACTN1P12814 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACTN1P12814 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACTN1P12814 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACTN1P12814 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACTN1P12814 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACTN1P12814 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACTN1P12814 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACTN1P12814 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACTN1P12814 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ACTN1P12814 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ACTN1P12814 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ACTN1P12814 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ACTN1P12814 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ACTN1P12814 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ACTN1P12814 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ACTN1P12814 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ACTN1P12814 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACTN1P12814 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACTN1P12814 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACTN1P12814 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACTN1P12814 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACTN1P12814 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACTN1P12814 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACTN1P12814 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ACTN1P12814 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ACTN1P12814 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ACTN1P12814 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACTN1P12814 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ACTN1P12814 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACTN1P12814 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACTN1P12814 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACTN1P12814 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACTN1P12814 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACTN1P12814 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACTN1P12814 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ACTN1P12814 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACTN1P12814 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACTN1P12814 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACTN1P12814 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ACTN1P12814 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ACTN1P12814 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ACTN1P12814 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ACTN1P12814 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ACTN1P12814 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ACTN1P12814 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ACTN1P12814 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ACTN1P12814 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ACTN1P12814 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ACTN1P12814 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ACTN1P12814 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ACTN1P12814 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ACTN1P12814 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ACTN1P12814 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACTN1P12814 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACTN1P12814 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACTN1P12814 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACTN1P12814 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACTN1P12814 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ACTN1P12814 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACTN1P12814 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACTN1P12814 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACTN1P12814 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ACTN1P12814 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ACTN1P12814 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ACTN1P12814 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ACTN1P12814 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACTN1P12814 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACTN1P12814 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACTN1P12814 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACTN1P12814 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACTN1P12814 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACTN1P12814 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACTN1P12814 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACTN1P12814 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACTN1P12814 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms