Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEFHP12036 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEFHP12036 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEFHP12036 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEFHP12036 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEFHP12036 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NEFHP12036 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEFHP12036 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEFHP12036 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEFHP12036 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFHP12036 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFHP12036 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFHP12036 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFHP12036 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFHP12036 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFHP12036 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFHP12036 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFHP12036 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFHP12036 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFHP12036 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFHP12036 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFHP12036 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFHP12036 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFHP12036 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFHP12036 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFHP12036 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFHP12036 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFHP12036 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFHP12036 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFHP12036 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFHP12036 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEFHP12036 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEFHP12036 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEFHP12036 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NEFHP12036 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEFHP12036 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEFHP12036 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEFHP12036 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEFHP12036 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NEFHP12036 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEFHP12036 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEFHP12036 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NEFHP12036 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NEFHP12036 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEFHP12036 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEFHP12036 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEFHP12036 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEFHP12036 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEFHP12036 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEFHP12036 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEFHP12036 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEFHP12036 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEFHP12036 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEFHP12036 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEFHP12036 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEFHP12036 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEFHP12036 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEFHP12036 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEFHP12036 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEFHP12036 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NEFHP12036 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEFHP12036 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEFHP12036 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEFHP12036 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEFHP12036 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEFHP12036 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFHP12036 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFHP12036 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFHP12036 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFHP12036 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFHP12036 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFHP12036 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFHP12036 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFHP12036 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFHP12036 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFHP12036 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFHP12036 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFHP12036 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFHP12036 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFHP12036 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFHP12036 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFHP12036 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFHP12036 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFHP12036 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFHP12036 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFHP12036 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFHP12036 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFHP12036 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFHP12036 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFHP12036 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFHP12036 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFHP12036 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFHP12036 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFHP12036 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFHP12036 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFHP12036 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFHP12036 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFHP12036 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFHP12036 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFHP12036 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms