Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
TOP2AP11388 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC42.19■■■■■ 4.34
TOP2AP11388 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC42.19■■■■■ 4.34
TOP2AP11388 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC42.19■■■■■ 4.34
TOP2AP11388 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
TOP2AP11388 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
TOP2AP11388 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
TOP2AP11388 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
TOP2AP11388 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC42.18■■■■■ 4.34
TOP2AP11388 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
TOP2AP11388 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC42.16■■■■■ 4.34
TOP2AP11388 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
TOP2AP11388 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC42.16■■■■■ 4.34
TOP2AP11388 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
TOP2AP11388 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
TOP2AP11388 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
TOP2AP11388 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
TOP2AP11388 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
TOP2AP11388 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
TOP2AP11388 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
TOP2AP11388 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
TOP2AP11388 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
TOP2AP11388 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
TOP2AP11388 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC42.13■■■■■ 4.33
TOP2AP11388 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC42.13■■■■■ 4.33
TOP2AP11388 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC42.13■■■■■ 4.33
TOP2AP11388 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
TOP2AP11388 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
TOP2AP11388 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC42.12■■■■■ 4.33
TOP2AP11388 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
TOP2AP11388 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.11■■■■■ 4.33
TOP2AP11388 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
TOP2AP11388 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
TOP2AP11388 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC42.11■■■■■ 4.33
TOP2AP11388 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC42.11■■■■■ 4.33
TOP2AP11388 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC42.11■■■■■ 4.33
TOP2AP11388 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC42.11■■■■■ 4.33
TOP2AP11388 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
TOP2AP11388 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC42.1■■■■■ 4.33
TOP2AP11388 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
TOP2AP11388 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
TOP2AP11388 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC42.1■■■■■ 4.33
TOP2AP11388 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC42.1■■■■■ 4.33
TOP2AP11388 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC42.1■■■■■ 4.33
TOP2AP11388 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
TOP2AP11388 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC42.09■■■■■ 4.33
TOP2AP11388 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC42.08■■■■■ 4.33
TOP2AP11388 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
TOP2AP11388 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
TOP2AP11388 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
TOP2AP11388 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
TOP2AP11388 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC42.07■■■■■ 4.33
TOP2AP11388 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
TOP2AP11388 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
TOP2AP11388 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
TOP2AP11388 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
TOP2AP11388 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
TOP2AP11388 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC42.05■■■■■ 4.32
TOP2AP11388 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
TOP2AP11388 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
TOP2AP11388 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
TOP2AP11388 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
TOP2AP11388 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
TOP2AP11388 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.04■■■■■ 4.32
TOP2AP11388 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
TOP2AP11388 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC42.03■■■■■ 4.32
TOP2AP11388 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
TOP2AP11388 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC42.03■■■■■ 4.32
TOP2AP11388 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
TOP2AP11388 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC42.02■■■■■ 4.32
TOP2AP11388 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC42.02■■■■■ 4.32
TOP2AP11388 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
TOP2AP11388 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
TOP2AP11388 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
TOP2AP11388 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
TOP2AP11388 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
TOP2AP11388 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
TOP2AP11388 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC41.99■■■■■ 4.31
TOP2AP11388 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC41.99■■■■■ 4.31
TOP2AP11388 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
TOP2AP11388 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.98■■■■■ 4.31
TOP2AP11388 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
TOP2AP11388 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC41.97■■■■■ 4.31
TOP2AP11388 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC41.97■■■■■ 4.31
TOP2AP11388 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
TOP2AP11388 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
TOP2AP11388 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
TOP2AP11388 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
TOP2AP11388 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC41.95■■■■■ 4.31
TOP2AP11388 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC41.95■■■■■ 4.31
TOP2AP11388 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
TOP2AP11388 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
TOP2AP11388 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
TOP2AP11388 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC41.92■■■■■ 4.3
TOP2AP11388 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
TOP2AP11388 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC41.91■■■■■ 4.3
TOP2AP11388 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
TOP2AP11388 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
TOP2AP11388 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC41.91■■■■■ 4.3
TOP2AP11388 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC41.91■■■■■ 4.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms