Protein–RNA interactions for Protein: P10745

RBP3, Retinol-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP3P10745 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBP3P10745 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBP3P10745 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBP3P10745 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBP3P10745 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBP3P10745 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBP3P10745 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBP3P10745 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RBP3P10745 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBP3P10745 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBP3P10745 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBP3P10745 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBP3P10745 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBP3P10745 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBP3P10745 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBP3P10745 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBP3P10745 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBP3P10745 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBP3P10745 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBP3P10745 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBP3P10745 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBP3P10745 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RBP3P10745 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBP3P10745 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBP3P10745 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBP3P10745 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBP3P10745 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBP3P10745 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBP3P10745 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBP3P10745 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBP3P10745 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBP3P10745 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBP3P10745 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBP3P10745 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBP3P10745 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBP3P10745 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBP3P10745 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBP3P10745 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBP3P10745 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBP3P10745 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RBP3P10745 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBP3P10745 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBP3P10745 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBP3P10745 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBP3P10745 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBP3P10745 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBP3P10745 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBP3P10745 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBP3P10745 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBP3P10745 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBP3P10745 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBP3P10745 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBP3P10745 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBP3P10745 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBP3P10745 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBP3P10745 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBP3P10745 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBP3P10745 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBP3P10745 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBP3P10745 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBP3P10745 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBP3P10745 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBP3P10745 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBP3P10745 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBP3P10745 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBP3P10745 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBP3P10745 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBP3P10745 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBP3P10745 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBP3P10745 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBP3P10745 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RBP3P10745 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBP3P10745 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBP3P10745 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RBP3P10745 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBP3P10745 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBP3P10745 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBP3P10745 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBP3P10745 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBP3P10745 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBP3P10745 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBP3P10745 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBP3P10745 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBP3P10745 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBP3P10745 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBP3P10745 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RBP3P10745 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBP3P10745 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBP3P10745 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBP3P10745 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBP3P10745 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBP3P10745 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBP3P10745 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBP3P10745 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RBP3P10745 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBP3P10745 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBP3P10745 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBP3P10745 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBP3P10745 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBP3P10745 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms