Protein–RNA interactions for Protein: P10451

SPP1, Osteopontin, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPP1P10451 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPP1P10451 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPP1P10451 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPP1P10451 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPP1P10451 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPP1P10451 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SPP1P10451 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPP1P10451 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPP1P10451 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPP1P10451 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPP1P10451 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPP1P10451 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPP1P10451 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPP1P10451 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPP1P10451 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPP1P10451 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPP1P10451 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPP1P10451 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPP1P10451 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPP1P10451 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPP1P10451 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPP1P10451 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPP1P10451 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPP1P10451 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPP1P10451 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPP1P10451 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPP1P10451 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPP1P10451 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPP1P10451 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPP1P10451 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPP1P10451 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPP1P10451 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPP1P10451 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPP1P10451 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPP1P10451 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPP1P10451 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPP1P10451 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPP1P10451 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPP1P10451 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPP1P10451 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPP1P10451 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPP1P10451 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPP1P10451 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPP1P10451 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPP1P10451 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPP1P10451 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPP1P10451 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPP1P10451 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPP1P10451 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPP1P10451 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPP1P10451 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPP1P10451 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPP1P10451 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPP1P10451 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPP1P10451 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPP1P10451 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPP1P10451 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPP1P10451 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPP1P10451 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPP1P10451 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPP1P10451 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPP1P10451 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPP1P10451 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SPP1P10451 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPP1P10451 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPP1P10451 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPP1P10451 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPP1P10451 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPP1P10451 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPP1P10451 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPP1P10451 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPP1P10451 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPP1P10451 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPP1P10451 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPP1P10451 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPP1P10451 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SPP1P10451 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPP1P10451 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPP1P10451 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPP1P10451 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPP1P10451 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPP1P10451 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPP1P10451 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPP1P10451 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPP1P10451 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPP1P10451 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPP1P10451 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPP1P10451 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPP1P10451 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPP1P10451 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPP1P10451 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPP1P10451 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPP1P10451 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPP1P10451 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPP1P10451 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPP1P10451 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPP1P10451 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPP1P10451 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPP1P10451 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPP1P10451 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms