Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCL3P10147 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCL3P10147 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCL3P10147 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCL3P10147 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCL3P10147 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL3P10147 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL3P10147 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL3P10147 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL3P10147 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL3P10147 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL3P10147 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL3P10147 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCL3P10147 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCL3P10147 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCL3P10147 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCL3P10147 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL3P10147 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL3P10147 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL3P10147 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL3P10147 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL3P10147 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL3P10147 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL3P10147 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL3P10147 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL3P10147 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL3P10147 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL3P10147 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCL3P10147 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCL3P10147 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCL3P10147 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCL3P10147 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCL3P10147 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCL3P10147 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCL3P10147 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCL3P10147 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCL3P10147 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCL3P10147 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCL3P10147 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCL3P10147 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCL3P10147 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCL3P10147 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCL3P10147 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCL3P10147 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCL3P10147 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCL3P10147 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCL3P10147 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCL3P10147 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCL3P10147 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCL3P10147 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCL3P10147 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCL3P10147 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCL3P10147 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCL3P10147 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCL3P10147 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCL3P10147 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCL3P10147 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCL3P10147 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCL3P10147 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCL3P10147 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCL3P10147 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCL3P10147 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCL3P10147 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCL3P10147 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCL3P10147 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCL3P10147 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCL3P10147 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCL3P10147 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCL3P10147 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCL3P10147 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCL3P10147 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCL3P10147 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCL3P10147 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCL3P10147 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCL3P10147 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCL3P10147 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCL3P10147 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCL3P10147 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCL3P10147 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCL3P10147 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCL3P10147 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCL3P10147 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCL3P10147 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCL3P10147 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCL3P10147 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCL3P10147 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCL3P10147 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCL3P10147 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCL3P10147 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCL3P10147 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCL3P10147 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCL3P10147 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCL3P10147 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCL3P10147 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCL3P10147 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCL3P10147 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCL3P10147 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCL3P10147 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCL3P10147 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCL3P10147 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms