Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
PGA3P0DJD8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PGA3P0DJD8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PGA3P0DJD8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PGA3P0DJD8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PGA3P0DJD8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PGA3P0DJD8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PGA3P0DJD8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PGA3P0DJD8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PGA3P0DJD8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PGA3P0DJD8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PGA3P0DJD8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PGA3P0DJD8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PGA3P0DJD8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PGA3P0DJD8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PGA3P0DJD8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PGA3P0DJD8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PGA3P0DJD8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PGA3P0DJD8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PGA3P0DJD8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PGA3P0DJD8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PGA3P0DJD8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PGA3P0DJD8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PGA3P0DJD8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PGA3P0DJD8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PGA3P0DJD8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PGA3P0DJD8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PGA3P0DJD8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PGA3P0DJD8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PGA3P0DJD8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PGA3P0DJD8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PGA3P0DJD8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PGA3P0DJD8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PGA3P0DJD8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PGA3P0DJD8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PGA3P0DJD8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PGA3P0DJD8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PGA3P0DJD8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms