Protein–RNA interactions for Protein: P0CG40

SP9, Transcription factor Sp9, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP9P0CG40 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SP9P0CG40 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SP9P0CG40 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SP9P0CG40 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SP9P0CG40 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SP9P0CG40 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SP9P0CG40 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SP9P0CG40 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SP9P0CG40 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SP9P0CG40 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SP9P0CG40 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SP9P0CG40 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SP9P0CG40 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SP9P0CG40 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SP9P0CG40 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SP9P0CG40 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SP9P0CG40 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SP9P0CG40 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SP9P0CG40 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SP9P0CG40 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SP9P0CG40 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SP9P0CG40 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SP9P0CG40 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SP9P0CG40 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SP9P0CG40 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SP9P0CG40 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SP9P0CG40 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SP9P0CG40 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SP9P0CG40 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SP9P0CG40 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SP9P0CG40 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SP9P0CG40 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SP9P0CG40 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SP9P0CG40 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SP9P0CG40 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SP9P0CG40 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SP9P0CG40 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SP9P0CG40 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SP9P0CG40 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SP9P0CG40 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SP9P0CG40 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SP9P0CG40 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SP9P0CG40 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SP9P0CG40 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SP9P0CG40 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SP9P0CG40 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SP9P0CG40 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SP9P0CG40 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SP9P0CG40 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SP9P0CG40 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SP9P0CG40 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SP9P0CG40 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SP9P0CG40 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SP9P0CG40 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SP9P0CG40 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SP9P0CG40 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SP9P0CG40 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SP9P0CG40 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SP9P0CG40 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SP9P0CG40 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SP9P0CG40 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SP9P0CG40 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SP9P0CG40 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SP9P0CG40 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SP9P0CG40 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SP9P0CG40 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SP9P0CG40 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SP9P0CG40 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SP9P0CG40 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SP9P0CG40 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SP9P0CG40 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SP9P0CG40 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SP9P0CG40 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SP9P0CG40 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SP9P0CG40 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SP9P0CG40 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SP9P0CG40 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SP9P0CG40 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SP9P0CG40 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SP9P0CG40 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SP9P0CG40 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SP9P0CG40 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SP9P0CG40 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SP9P0CG40 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SP9P0CG40 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SP9P0CG40 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SP9P0CG40 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SP9P0CG40 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SP9P0CG40 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SP9P0CG40 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SP9P0CG40 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SP9P0CG40 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SP9P0CG40 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SP9P0CG40 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SP9P0CG40 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SP9P0CG40 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SP9P0CG40 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SP9P0CG40 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SP9P0CG40 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SP9P0CG40 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms