Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM200BP0CF97 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM200BP0CF97 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM200BP0CF97 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM200BP0CF97 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM200BP0CF97 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM200BP0CF97 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM200BP0CF97 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM200BP0CF97 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM200BP0CF97 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM200BP0CF97 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FAM200BP0CF97 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FAM200BP0CF97 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FAM200BP0CF97 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FAM200BP0CF97 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAM200BP0CF97 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAM200BP0CF97 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM200BP0CF97 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM200BP0CF97 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM200BP0CF97 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM200BP0CF97 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM200BP0CF97 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM200BP0CF97 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM200BP0CF97 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM200BP0CF97 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM200BP0CF97 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM200BP0CF97 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM200BP0CF97 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM200BP0CF97 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM200BP0CF97 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM200BP0CF97 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM200BP0CF97 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM200BP0CF97 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM200BP0CF97 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM200BP0CF97 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM200BP0CF97 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM200BP0CF97 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM200BP0CF97 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM200BP0CF97 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM200BP0CF97 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
FAM200BP0CF97 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FAM200BP0CF97 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM200BP0CF97 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM200BP0CF97 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM200BP0CF97 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM200BP0CF97 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM200BP0CF97 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM200BP0CF97 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM200BP0CF97 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM200BP0CF97 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM200BP0CF97 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM200BP0CF97 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM200BP0CF97 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM200BP0CF97 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM200BP0CF97 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM200BP0CF97 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM200BP0CF97 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM200BP0CF97 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM200BP0CF97 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM200BP0CF97 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM200BP0CF97 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM200BP0CF97 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM200BP0CF97 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM200BP0CF97 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM200BP0CF97 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM200BP0CF97 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM200BP0CF97 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM200BP0CF97 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM200BP0CF97 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM200BP0CF97 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM200BP0CF97 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM200BP0CF97 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM200BP0CF97 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM200BP0CF97 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM200BP0CF97 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAM200BP0CF97 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAM200BP0CF97 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAM200BP0CF97 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
FAM200BP0CF97 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAM200BP0CF97 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM200BP0CF97 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM200BP0CF97 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM200BP0CF97 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM200BP0CF97 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM200BP0CF97 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM200BP0CF97 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM200BP0CF97 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM200BP0CF97 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM200BP0CF97 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM200BP0CF97 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM200BP0CF97 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM200BP0CF97 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM200BP0CF97 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM200BP0CF97 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM200BP0CF97 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM200BP0CF97 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM200BP0CF97 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM200BP0CF97 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM200BP0CF97 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM200BP0CF97 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms