Protein–RNA interactions for Protein: P08727

KRT19, Keratin, type I cytoskeletal 19, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT19P08727 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT19P08727 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT19P08727 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT19P08727 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT19P08727 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT19P08727 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT19P08727 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT19P08727 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT19P08727 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT19P08727 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT19P08727 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT19P08727 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT19P08727 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT19P08727 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT19P08727 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT19P08727 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT19P08727 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT19P08727 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT19P08727 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT19P08727 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT19P08727 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT19P08727 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT19P08727 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT19P08727 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT19P08727 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT19P08727 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT19P08727 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KRT19P08727 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
KRT19P08727 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT19P08727 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT19P08727 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT19P08727 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT19P08727 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT19P08727 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT19P08727 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT19P08727 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT19P08727 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT19P08727 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT19P08727 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT19P08727 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT19P08727 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT19P08727 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT19P08727 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT19P08727 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT19P08727 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT19P08727 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT19P08727 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT19P08727 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT19P08727 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT19P08727 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT19P08727 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT19P08727 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT19P08727 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT19P08727 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT19P08727 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT19P08727 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT19P08727 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT19P08727 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT19P08727 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT19P08727 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT19P08727 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT19P08727 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT19P08727 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT19P08727 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT19P08727 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT19P08727 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT19P08727 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT19P08727 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT19P08727 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT19P08727 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT19P08727 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT19P08727 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT19P08727 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT19P08727 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT19P08727 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT19P08727 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT19P08727 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT19P08727 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT19P08727 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT19P08727 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT19P08727 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT19P08727 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT19P08727 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT19P08727 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT19P08727 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT19P08727 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT19P08727 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT19P08727 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT19P08727 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT19P08727 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT19P08727 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT19P08727 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT19P08727 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT19P08727 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT19P08727 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT19P08727 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT19P08727 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT19P08727 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT19P08727 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT19P08727 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms