Protein–RNA interactions for Protein: P05937

CALB1, Calbindin, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB1P05937 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALB1P05937 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALB1P05937 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CALB1P05937 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALB1P05937 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALB1P05937 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALB1P05937 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALB1P05937 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CALB1P05937 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALB1P05937 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CALB1P05937 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CALB1P05937 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CALB1P05937 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CALB1P05937 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CALB1P05937 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CALB1P05937 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CALB1P05937 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CALB1P05937 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CALB1P05937 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CALB1P05937 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALB1P05937 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALB1P05937 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALB1P05937 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALB1P05937 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALB1P05937 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALB1P05937 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALB1P05937 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALB1P05937 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALB1P05937 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALB1P05937 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALB1P05937 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALB1P05937 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALB1P05937 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALB1P05937 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALB1P05937 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALB1P05937 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALB1P05937 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALB1P05937 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALB1P05937 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALB1P05937 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALB1P05937 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CALB1P05937 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CALB1P05937 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALB1P05937 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALB1P05937 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALB1P05937 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALB1P05937 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALB1P05937 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALB1P05937 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALB1P05937 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALB1P05937 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALB1P05937 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALB1P05937 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALB1P05937 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CALB1P05937 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CALB1P05937 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CALB1P05937 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CALB1P05937 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CALB1P05937 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CALB1P05937 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CALB1P05937 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CALB1P05937 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CALB1P05937 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CALB1P05937 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CALB1P05937 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CALB1P05937 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CALB1P05937 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALB1P05937 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALB1P05937 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALB1P05937 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALB1P05937 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALB1P05937 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CALB1P05937 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CALB1P05937 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CALB1P05937 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CALB1P05937 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CALB1P05937 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CALB1P05937 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALB1P05937 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALB1P05937 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALB1P05937 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALB1P05937 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALB1P05937 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALB1P05937 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALB1P05937 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CALB1P05937 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALB1P05937 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALB1P05937 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALB1P05937 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALB1P05937 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALB1P05937 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALB1P05937 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALB1P05937 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALB1P05937 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALB1P05937 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALB1P05937 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALB1P05937 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALB1P05937 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALB1P05937 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALB1P05937 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms