Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR3DP05423 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR3DP05423 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR3DP05423 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR3DP05423 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR3DP05423 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR3DP05423 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR3DP05423 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR3DP05423 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR3DP05423 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR3DP05423 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR3DP05423 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR3DP05423 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR3DP05423 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR3DP05423 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR3DP05423 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR3DP05423 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR3DP05423 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR3DP05423 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR3DP05423 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR3DP05423 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR3DP05423 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR3DP05423 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR3DP05423 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR3DP05423 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR3DP05423 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR3DP05423 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR3DP05423 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR3DP05423 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR3DP05423 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR3DP05423 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR3DP05423 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLR3DP05423 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
POLR3DP05423 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLR3DP05423 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLR3DP05423 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLR3DP05423 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLR3DP05423 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLR3DP05423 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLR3DP05423 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR3DP05423 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR3DP05423 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR3DP05423 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR3DP05423 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR3DP05423 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR3DP05423 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR3DP05423 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR3DP05423 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR3DP05423 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR3DP05423 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR3DP05423 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR3DP05423 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR3DP05423 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR3DP05423 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR3DP05423 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLR3DP05423 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLR3DP05423 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLR3DP05423 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLR3DP05423 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLR3DP05423 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLR3DP05423 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR3DP05423 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR3DP05423 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR3DP05423 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR3DP05423 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR3DP05423 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR3DP05423 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR3DP05423 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR3DP05423 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLR3DP05423 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLR3DP05423 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLR3DP05423 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
POLR3DP05423 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
POLR3DP05423 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
POLR3DP05423 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR3DP05423 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR3DP05423 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR3DP05423 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR3DP05423 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR3DP05423 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR3DP05423 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR3DP05423 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR3DP05423 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR3DP05423 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR3DP05423 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR3DP05423 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR3DP05423 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR3DP05423 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR3DP05423 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR3DP05423 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR3DP05423 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR3DP05423 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR3DP05423 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR3DP05423 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR3DP05423 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR3DP05423 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR3DP05423 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR3DP05423 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR3DP05423 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR3DP05423 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms