Protein–RNA interactions for Protein: P05060

CHGB, Secretogranin-1, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGBP05060 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHGBP05060 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHGBP05060 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHGBP05060 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHGBP05060 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHGBP05060 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHGBP05060 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHGBP05060 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHGBP05060 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHGBP05060 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHGBP05060 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHGBP05060 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CHGBP05060 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CHGBP05060 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHGBP05060 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHGBP05060 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHGBP05060 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CHGBP05060 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CHGBP05060 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHGBP05060 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHGBP05060 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHGBP05060 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CHGBP05060 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHGBP05060 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHGBP05060 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHGBP05060 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHGBP05060 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHGBP05060 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHGBP05060 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHGBP05060 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHGBP05060 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHGBP05060 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHGBP05060 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHGBP05060 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CHGBP05060 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHGBP05060 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHGBP05060 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHGBP05060 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHGBP05060 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHGBP05060 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHGBP05060 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHGBP05060 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHGBP05060 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHGBP05060 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CHGBP05060 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHGBP05060 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHGBP05060 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHGBP05060 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHGBP05060 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHGBP05060 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHGBP05060 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHGBP05060 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHGBP05060 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHGBP05060 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHGBP05060 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHGBP05060 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHGBP05060 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHGBP05060 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHGBP05060 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHGBP05060 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHGBP05060 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHGBP05060 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHGBP05060 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHGBP05060 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHGBP05060 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHGBP05060 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHGBP05060 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CHGBP05060 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHGBP05060 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHGBP05060 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHGBP05060 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHGBP05060 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHGBP05060 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHGBP05060 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHGBP05060 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHGBP05060 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHGBP05060 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHGBP05060 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHGBP05060 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHGBP05060 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHGBP05060 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHGBP05060 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHGBP05060 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHGBP05060 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHGBP05060 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHGBP05060 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHGBP05060 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHGBP05060 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHGBP05060 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHGBP05060 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHGBP05060 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHGBP05060 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHGBP05060 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHGBP05060 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHGBP05060 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHGBP05060 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHGBP05060 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHGBP05060 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHGBP05060 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHGBP05060 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms