Protein–RNA interactions for Protein: P02458

COL2A1, Collagen alpha-1(II) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL2A1P02458 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
COL2A1P02458 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
COL2A1P02458 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
COL2A1P02458 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
COL2A1P02458 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
COL2A1P02458 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
COL2A1P02458 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
COL2A1P02458 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
COL2A1P02458 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
COL2A1P02458 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
COL2A1P02458 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
COL2A1P02458 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL2A1P02458 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL2A1P02458 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL2A1P02458 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL2A1P02458 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL2A1P02458 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL2A1P02458 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL2A1P02458 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL2A1P02458 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL2A1P02458 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL2A1P02458 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL2A1P02458 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
COL2A1P02458 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
COL2A1P02458 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
COL2A1P02458 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
COL2A1P02458 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COL2A1P02458 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COL2A1P02458 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
COL2A1P02458 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28■■■□□ 2.07
COL2A1P02458 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COL2A1P02458 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL2A1P02458 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
COL2A1P02458 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL2A1P02458 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL2A1P02458 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL2A1P02458 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL2A1P02458 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL2A1P02458 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL2A1P02458 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL2A1P02458 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL2A1P02458 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
COL2A1P02458 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL2A1P02458 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL2A1P02458 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
COL2A1P02458 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL2A1P02458 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
COL2A1P02458 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL2A1P02458 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL2A1P02458 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL2A1P02458 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL2A1P02458 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL2A1P02458 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL2A1P02458 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL2A1P02458 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL2A1P02458 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
COL2A1P02458 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
COL2A1P02458 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
COL2A1P02458 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
COL2A1P02458 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
COL2A1P02458 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL2A1P02458 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL2A1P02458 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
COL2A1P02458 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
COL2A1P02458 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
COL2A1P02458 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
COL2A1P02458 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
COL2A1P02458 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COL2A1P02458 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COL2A1P02458 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
COL2A1P02458 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COL2A1P02458 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
COL2A1P02458 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL2A1P02458 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL2A1P02458 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL2A1P02458 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL2A1P02458 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL2A1P02458 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL2A1P02458 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL2A1P02458 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL2A1P02458 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
COL2A1P02458 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL2A1P02458 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL2A1P02458 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
COL2A1P02458 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL2A1P02458 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL2A1P02458 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL2A1P02458 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL2A1P02458 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL2A1P02458 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
COL2A1P02458 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL2A1P02458 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL2A1P02458 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
COL2A1P02458 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL2A1P02458 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL2A1P02458 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL2A1P02458 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL2A1P02458 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL2A1P02458 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL2A1P02458 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms