Protein–RNA interactions for Protein: P01861

IGHG4, Immunoglobulin heavy constant gamma 4, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHG4P01861 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IGHG4P01861 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IGHG4P01861 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IGHG4P01861 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGHG4P01861 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGHG4P01861 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGHG4P01861 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGHG4P01861 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGHG4P01861 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGHG4P01861 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGHG4P01861 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGHG4P01861 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGHG4P01861 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGHG4P01861 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGHG4P01861 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGHG4P01861 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGHG4P01861 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGHG4P01861 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGHG4P01861 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGHG4P01861 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGHG4P01861 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
IGHG4P01861 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGHG4P01861 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGHG4P01861 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGHG4P01861 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGHG4P01861 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGHG4P01861 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGHG4P01861 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGHG4P01861 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGHG4P01861 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGHG4P01861 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGHG4P01861 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGHG4P01861 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGHG4P01861 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGHG4P01861 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
IGHG4P01861 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IGHG4P01861 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IGHG4P01861 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGHG4P01861 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGHG4P01861 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGHG4P01861 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGHG4P01861 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGHG4P01861 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGHG4P01861 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGHG4P01861 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGHG4P01861 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
IGHG4P01861 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGHG4P01861 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGHG4P01861 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGHG4P01861 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGHG4P01861 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGHG4P01861 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGHG4P01861 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGHG4P01861 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGHG4P01861 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGHG4P01861 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGHG4P01861 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGHG4P01861 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGHG4P01861 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGHG4P01861 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGHG4P01861 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGHG4P01861 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGHG4P01861 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGHG4P01861 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGHG4P01861 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGHG4P01861 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGHG4P01861 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGHG4P01861 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGHG4P01861 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGHG4P01861 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IGHG4P01861 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGHG4P01861 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IGHG4P01861 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGHG4P01861 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGHG4P01861 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGHG4P01861 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGHG4P01861 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGHG4P01861 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGHG4P01861 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGHG4P01861 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
IGHG4P01861 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGHG4P01861 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGHG4P01861 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGHG4P01861 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGHG4P01861 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGHG4P01861 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGHG4P01861 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGHG4P01861 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGHG4P01861 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGHG4P01861 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGHG4P01861 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGHG4P01861 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGHG4P01861 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGHG4P01861 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGHG4P01861 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGHG4P01861 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGHG4P01861 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGHG4P01861 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IGHG4P01861 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGHG4P01861 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms