Protein–RNA interactions for Protein: P01375

TNF, Tumor necrosis factor, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFP01375 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFP01375 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFP01375 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFP01375 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFP01375 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFP01375 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFP01375 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFP01375 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFP01375 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFP01375 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFP01375 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFP01375 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFP01375 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFP01375 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFP01375 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFP01375 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFP01375 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFP01375 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFP01375 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFP01375 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFP01375 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFP01375 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFP01375 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFP01375 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFP01375 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFP01375 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFP01375 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFP01375 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFP01375 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFP01375 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFP01375 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFP01375 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFP01375 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFP01375 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFP01375 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFP01375 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFP01375 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFP01375 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFP01375 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFP01375 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFP01375 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFP01375 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFP01375 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFP01375 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFP01375 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFP01375 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFP01375 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFP01375 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFP01375 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFP01375 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFP01375 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFP01375 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNFP01375 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNFP01375 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFP01375 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFP01375 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFP01375 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFP01375 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFP01375 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFP01375 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFP01375 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFP01375 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFP01375 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFP01375 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFP01375 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFP01375 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFP01375 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFP01375 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFP01375 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFP01375 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFP01375 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFP01375 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFP01375 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFP01375 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFP01375 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFP01375 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFP01375 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFP01375 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFP01375 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFP01375 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFP01375 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFP01375 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFP01375 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFP01375 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFP01375 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFP01375 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFP01375 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFP01375 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFP01375 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFP01375 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFP01375 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFP01375 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFP01375 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFP01375 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFP01375 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFP01375 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFP01375 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFP01375 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFP01375 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFP01375 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms