Protein–RNA interactions for Protein: P01130

LDLR, Low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRP01130 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LDLRP01130 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LDLRP01130 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LDLRP01130 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LDLRP01130 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LDLRP01130 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LDLRP01130 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LDLRP01130 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LDLRP01130 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LDLRP01130 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LDLRP01130 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LDLRP01130 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LDLRP01130 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LDLRP01130 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LDLRP01130 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LDLRP01130 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LDLRP01130 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LDLRP01130 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LDLRP01130 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LDLRP01130 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LDLRP01130 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LDLRP01130 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LDLRP01130 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LDLRP01130 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LDLRP01130 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LDLRP01130 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LDLRP01130 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LDLRP01130 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LDLRP01130 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LDLRP01130 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LDLRP01130 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LDLRP01130 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LDLRP01130 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LDLRP01130 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LDLRP01130 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LDLRP01130 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LDLRP01130 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LDLRP01130 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LDLRP01130 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LDLRP01130 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LDLRP01130 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LDLRP01130 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LDLRP01130 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LDLRP01130 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LDLRP01130 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LDLRP01130 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LDLRP01130 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LDLRP01130 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LDLRP01130 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LDLRP01130 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LDLRP01130 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LDLRP01130 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LDLRP01130 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LDLRP01130 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LDLRP01130 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
LDLRP01130 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LDLRP01130 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LDLRP01130 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LDLRP01130 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LDLRP01130 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LDLRP01130 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDLRP01130 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDLRP01130 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDLRP01130 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDLRP01130 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDLRP01130 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDLRP01130 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDLRP01130 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDLRP01130 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDLRP01130 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDLRP01130 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDLRP01130 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDLRP01130 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDLRP01130 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDLRP01130 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDLRP01130 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDLRP01130 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDLRP01130 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDLRP01130 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDLRP01130 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDLRP01130 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDLRP01130 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LDLRP01130 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDLRP01130 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDLRP01130 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDLRP01130 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDLRP01130 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDLRP01130 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDLRP01130 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDLRP01130 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDLRP01130 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDLRP01130 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDLRP01130 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDLRP01130 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDLRP01130 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDLRP01130 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDLRP01130 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDLRP01130 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDLRP01130 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDLRP01130 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms