Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POP4O95707 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
POP4O95707 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POP4O95707 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
POP4O95707 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
POP4O95707 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POP4O95707 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POP4O95707 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POP4O95707 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
POP4O95707 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
POP4O95707 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POP4O95707 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POP4O95707 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POP4O95707 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POP4O95707 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POP4O95707 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POP4O95707 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POP4O95707 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POP4O95707 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POP4O95707 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POP4O95707 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POP4O95707 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POP4O95707 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POP4O95707 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POP4O95707 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POP4O95707 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POP4O95707 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POP4O95707 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POP4O95707 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
POP4O95707 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
POP4O95707 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
POP4O95707 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
POP4O95707 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POP4O95707 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POP4O95707 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POP4O95707 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POP4O95707 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
POP4O95707 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POP4O95707 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POP4O95707 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POP4O95707 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POP4O95707 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POP4O95707 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POP4O95707 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POP4O95707 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POP4O95707 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POP4O95707 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POP4O95707 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POP4O95707 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POP4O95707 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POP4O95707 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POP4O95707 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POP4O95707 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POP4O95707 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POP4O95707 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POP4O95707 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POP4O95707 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POP4O95707 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POP4O95707 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POP4O95707 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POP4O95707 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POP4O95707 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POP4O95707 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POP4O95707 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POP4O95707 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POP4O95707 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POP4O95707 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POP4O95707 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POP4O95707 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POP4O95707 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POP4O95707 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POP4O95707 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POP4O95707 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POP4O95707 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POP4O95707 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POP4O95707 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POP4O95707 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POP4O95707 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POP4O95707 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POP4O95707 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
POP4O95707 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POP4O95707 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POP4O95707 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POP4O95707 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
POP4O95707 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POP4O95707 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POP4O95707 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
POP4O95707 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POP4O95707 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POP4O95707 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POP4O95707 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
POP4O95707 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POP4O95707 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POP4O95707 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
POP4O95707 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POP4O95707 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POP4O95707 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POP4O95707 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
POP4O95707 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POP4O95707 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms