Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCNTO95613 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCNTO95613 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCNTO95613 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCNTO95613 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCNTO95613 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCNTO95613 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCNTO95613 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCNTO95613 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCNTO95613 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCNTO95613 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCNTO95613 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCNTO95613 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCNTO95613 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCNTO95613 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCNTO95613 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCNTO95613 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCNTO95613 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCNTO95613 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCNTO95613 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCNTO95613 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCNTO95613 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCNTO95613 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCNTO95613 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCNTO95613 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCNTO95613 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCNTO95613 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCNTO95613 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PCNTO95613 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCNTO95613 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCNTO95613 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCNTO95613 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PCNTO95613 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PCNTO95613 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PCNTO95613 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PCNTO95613 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PCNTO95613 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PCNTO95613 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PCNTO95613 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PCNTO95613 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PCNTO95613 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCNTO95613 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCNTO95613 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCNTO95613 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCNTO95613 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCNTO95613 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCNTO95613 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCNTO95613 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCNTO95613 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCNTO95613 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCNTO95613 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCNTO95613 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PCNTO95613 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PCNTO95613 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCNTO95613 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCNTO95613 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCNTO95613 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCNTO95613 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCNTO95613 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PCNTO95613 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCNTO95613 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCNTO95613 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCNTO95613 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCNTO95613 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCNTO95613 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PCNTO95613 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
PCNTO95613 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PCNTO95613 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCNTO95613 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCNTO95613 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCNTO95613 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCNTO95613 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCNTO95613 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCNTO95613 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCNTO95613 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCNTO95613 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCNTO95613 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCNTO95613 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCNTO95613 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCNTO95613 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCNTO95613 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCNTO95613 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCNTO95613 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCNTO95613 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCNTO95613 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCNTO95613 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCNTO95613 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCNTO95613 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCNTO95613 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCNTO95613 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCNTO95613 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCNTO95613 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCNTO95613 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCNTO95613 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCNTO95613 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCNTO95613 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCNTO95613 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCNTO95613 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCNTO95613 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PCNTO95613 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms