Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SEC24AO95486 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEC24AO95486 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEC24AO95486 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEC24AO95486 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEC24AO95486 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEC24AO95486 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEC24AO95486 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEC24AO95486 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SEC24AO95486 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEC24AO95486 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC24AO95486 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC24AO95486 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC24AO95486 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC24AO95486 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC24AO95486 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC24AO95486 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC24AO95486 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEC24AO95486 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEC24AO95486 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEC24AO95486 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEC24AO95486 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEC24AO95486 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEC24AO95486 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEC24AO95486 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SEC24AO95486 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEC24AO95486 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SEC24AO95486 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEC24AO95486 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEC24AO95486 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEC24AO95486 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEC24AO95486 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEC24AO95486 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEC24AO95486 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEC24AO95486 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEC24AO95486 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEC24AO95486 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEC24AO95486 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEC24AO95486 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEC24AO95486 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEC24AO95486 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEC24AO95486 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SEC24AO95486 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEC24AO95486 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEC24AO95486 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEC24AO95486 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEC24AO95486 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEC24AO95486 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEC24AO95486 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEC24AO95486 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEC24AO95486 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEC24AO95486 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEC24AO95486 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEC24AO95486 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEC24AO95486 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC24AO95486 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC24AO95486 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC24AO95486 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC24AO95486 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC24AO95486 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC24AO95486 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC24AO95486 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC24AO95486 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEC24AO95486 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEC24AO95486 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEC24AO95486 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEC24AO95486 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEC24AO95486 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEC24AO95486 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEC24AO95486 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEC24AO95486 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC24AO95486 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC24AO95486 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC24AO95486 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC24AO95486 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC24AO95486 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC24AO95486 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC24AO95486 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC24AO95486 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC24AO95486 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC24AO95486 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC24AO95486 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC24AO95486 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC24AO95486 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC24AO95486 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC24AO95486 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC24AO95486 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC24AO95486 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC24AO95486 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC24AO95486 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC24AO95486 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC24AO95486 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC24AO95486 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC24AO95486 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC24AO95486 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC24AO95486 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC24AO95486 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC24AO95486 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC24AO95486 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC24AO95486 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms