Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAPBO95292 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAPBO95292 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAPBO95292 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAPBO95292 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAPBO95292 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAPBO95292 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
VAPBO95292 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAPBO95292 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAPBO95292 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAPBO95292 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAPBO95292 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAPBO95292 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAPBO95292 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAPBO95292 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAPBO95292 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAPBO95292 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAPBO95292 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VAPBO95292 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VAPBO95292 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
VAPBO95292 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VAPBO95292 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VAPBO95292 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VAPBO95292 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VAPBO95292 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VAPBO95292 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VAPBO95292 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VAPBO95292 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VAPBO95292 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VAPBO95292 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAPBO95292 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAPBO95292 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAPBO95292 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAPBO95292 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAPBO95292 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAPBO95292 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAPBO95292 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAPBO95292 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAPBO95292 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAPBO95292 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAPBO95292 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAPBO95292 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAPBO95292 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAPBO95292 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAPBO95292 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAPBO95292 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAPBO95292 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAPBO95292 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAPBO95292 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAPBO95292 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VAPBO95292 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VAPBO95292 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VAPBO95292 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VAPBO95292 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
VAPBO95292 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VAPBO95292 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VAPBO95292 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VAPBO95292 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
VAPBO95292 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VAPBO95292 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VAPBO95292 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VAPBO95292 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VAPBO95292 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VAPBO95292 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VAPBO95292 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VAPBO95292 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VAPBO95292 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VAPBO95292 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
VAPBO95292 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
VAPBO95292 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VAPBO95292 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
VAPBO95292 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VAPBO95292 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VAPBO95292 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VAPBO95292 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VAPBO95292 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAPBO95292 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAPBO95292 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAPBO95292 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAPBO95292 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAPBO95292 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAPBO95292 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAPBO95292 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAPBO95292 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAPBO95292 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAPBO95292 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAPBO95292 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAPBO95292 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAPBO95292 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
VAPBO95292 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAPBO95292 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAPBO95292 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAPBO95292 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VAPBO95292 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VAPBO95292 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VAPBO95292 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VAPBO95292 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VAPBO95292 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VAPBO95292 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VAPBO95292 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms