Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RHOBTB3O94955 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RHOBTB3O94955 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RHOBTB3O94955 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RHOBTB3O94955 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RHOBTB3O94955 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RHOBTB3O94955 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RHOBTB3O94955 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RHOBTB3O94955 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RHOBTB3O94955 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RHOBTB3O94955 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RHOBTB3O94955 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RHOBTB3O94955 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RHOBTB3O94955 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RHOBTB3O94955 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RHOBTB3O94955 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RHOBTB3O94955 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RHOBTB3O94955 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RHOBTB3O94955 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RHOBTB3O94955 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RHOBTB3O94955 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RHOBTB3O94955 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RHOBTB3O94955 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RHOBTB3O94955 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RHOBTB3O94955 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RHOBTB3O94955 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RHOBTB3O94955 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RHOBTB3O94955 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RHOBTB3O94955 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RHOBTB3O94955 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RHOBTB3O94955 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RHOBTB3O94955 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RHOBTB3O94955 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RHOBTB3O94955 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RHOBTB3O94955 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RHOBTB3O94955 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RHOBTB3O94955 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RHOBTB3O94955 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RHOBTB3O94955 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RHOBTB3O94955 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RHOBTB3O94955 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RHOBTB3O94955 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RHOBTB3O94955 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RHOBTB3O94955 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RHOBTB3O94955 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RHOBTB3O94955 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RHOBTB3O94955 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RHOBTB3O94955 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RHOBTB3O94955 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RHOBTB3O94955 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RHOBTB3O94955 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RHOBTB3O94955 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RHOBTB3O94955 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RHOBTB3O94955 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RHOBTB3O94955 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RHOBTB3O94955 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RHOBTB3O94955 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RHOBTB3O94955 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RHOBTB3O94955 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RHOBTB3O94955 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RHOBTB3O94955 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RHOBTB3O94955 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RHOBTB3O94955 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RHOBTB3O94955 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RHOBTB3O94955 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RHOBTB3O94955 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RHOBTB3O94955 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RHOBTB3O94955 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RHOBTB3O94955 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RHOBTB3O94955 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RHOBTB3O94955 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RHOBTB3O94955 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RHOBTB3O94955 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RHOBTB3O94955 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RHOBTB3O94955 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RHOBTB3O94955 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RHOBTB3O94955 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RHOBTB3O94955 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RHOBTB3O94955 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RHOBTB3O94955 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RHOBTB3O94955 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RHOBTB3O94955 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RHOBTB3O94955 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RHOBTB3O94955 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RHOBTB3O94955 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RHOBTB3O94955 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RHOBTB3O94955 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RHOBTB3O94955 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RHOBTB3O94955 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RHOBTB3O94955 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RHOBTB3O94955 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RHOBTB3O94955 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RHOBTB3O94955 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RHOBTB3O94955 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RHOBTB3O94955 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RHOBTB3O94955 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RHOBTB3O94955 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RHOBTB3O94955 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RHOBTB3O94955 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RHOBTB3O94955 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms