Protein–RNA interactions for Protein: O76015

KRT38, Keratin, type I cuticular Ha8, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT38O76015 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT38O76015 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT38O76015 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT38O76015 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT38O76015 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT38O76015 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT38O76015 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT38O76015 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT38O76015 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT38O76015 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT38O76015 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT38O76015 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT38O76015 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT38O76015 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT38O76015 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT38O76015 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT38O76015 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT38O76015 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT38O76015 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT38O76015 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT38O76015 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT38O76015 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT38O76015 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT38O76015 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT38O76015 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT38O76015 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT38O76015 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT38O76015 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT38O76015 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT38O76015 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT38O76015 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT38O76015 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT38O76015 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT38O76015 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT38O76015 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT38O76015 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT38O76015 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT38O76015 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT38O76015 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT38O76015 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT38O76015 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT38O76015 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT38O76015 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT38O76015 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT38O76015 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT38O76015 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT38O76015 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT38O76015 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT38O76015 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT38O76015 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT38O76015 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT38O76015 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT38O76015 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT38O76015 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT38O76015 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT38O76015 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT38O76015 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT38O76015 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT38O76015 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT38O76015 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT38O76015 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT38O76015 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT38O76015 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT38O76015 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT38O76015 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT38O76015 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT38O76015 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT38O76015 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT38O76015 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT38O76015 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT38O76015 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT38O76015 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT38O76015 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT38O76015 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT38O76015 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT38O76015 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT38O76015 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT38O76015 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT38O76015 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT38O76015 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT38O76015 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT38O76015 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT38O76015 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT38O76015 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT38O76015 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT38O76015 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT38O76015 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT38O76015 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT38O76015 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT38O76015 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT38O76015 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT38O76015 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT38O76015 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT38O76015 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT38O76015 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT38O76015 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT38O76015 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT38O76015 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT38O76015 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT38O76015 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms