Protein–RNA interactions for Protein: O75487

GPC4, Glypican-4, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC4O75487 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC4O75487 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC4O75487 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC4O75487 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC4O75487 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC4O75487 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC4O75487 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC4O75487 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC4O75487 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC4O75487 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC4O75487 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC4O75487 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC4O75487 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC4O75487 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC4O75487 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC4O75487 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC4O75487 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC4O75487 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC4O75487 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC4O75487 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC4O75487 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC4O75487 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC4O75487 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC4O75487 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC4O75487 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC4O75487 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC4O75487 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC4O75487 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC4O75487 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC4O75487 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC4O75487 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC4O75487 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC4O75487 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC4O75487 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC4O75487 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC4O75487 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC4O75487 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC4O75487 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC4O75487 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC4O75487 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC4O75487 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC4O75487 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC4O75487 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC4O75487 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC4O75487 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC4O75487 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC4O75487 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC4O75487 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPC4O75487 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPC4O75487 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPC4O75487 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPC4O75487 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPC4O75487 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPC4O75487 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPC4O75487 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC4O75487 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC4O75487 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC4O75487 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC4O75487 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC4O75487 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC4O75487 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC4O75487 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC4O75487 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC4O75487 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC4O75487 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC4O75487 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC4O75487 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC4O75487 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC4O75487 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC4O75487 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC4O75487 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC4O75487 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC4O75487 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC4O75487 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC4O75487 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC4O75487 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC4O75487 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC4O75487 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC4O75487 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC4O75487 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC4O75487 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC4O75487 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC4O75487 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC4O75487 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC4O75487 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC4O75487 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC4O75487 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC4O75487 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPC4O75487 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPC4O75487 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPC4O75487 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPC4O75487 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GPC4O75487 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GPC4O75487 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPC4O75487 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPC4O75487 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GPC4O75487 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC4O75487 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC4O75487 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC4O75487 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms