Protein–RNA interactions for Protein: O75192

PEX11A, Peroxisomal membrane protein 11A, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX11AO75192 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX11AO75192 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX11AO75192 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX11AO75192 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX11AO75192 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX11AO75192 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX11AO75192 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX11AO75192 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX11AO75192 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX11AO75192 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX11AO75192 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX11AO75192 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX11AO75192 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX11AO75192 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX11AO75192 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX11AO75192 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX11AO75192 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX11AO75192 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX11AO75192 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX11AO75192 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX11AO75192 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX11AO75192 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX11AO75192 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX11AO75192 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX11AO75192 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PEX11AO75192 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PEX11AO75192 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PEX11AO75192 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PEX11AO75192 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PEX11AO75192 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PEX11AO75192 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PEX11AO75192 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX11AO75192 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX11AO75192 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX11AO75192 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX11AO75192 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX11AO75192 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX11AO75192 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEX11AO75192 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEX11AO75192 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEX11AO75192 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEX11AO75192 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEX11AO75192 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEX11AO75192 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEX11AO75192 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PEX11AO75192 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PEX11AO75192 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PEX11AO75192 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PEX11AO75192 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PEX11AO75192 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX11AO75192 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX11AO75192 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX11AO75192 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX11AO75192 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX11AO75192 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX11AO75192 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX11AO75192 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX11AO75192 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEX11AO75192 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEX11AO75192 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEX11AO75192 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PEX11AO75192 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEX11AO75192 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEX11AO75192 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEX11AO75192 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEX11AO75192 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEX11AO75192 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEX11AO75192 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PEX11AO75192 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PEX11AO75192 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PEX11AO75192 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PEX11AO75192 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PEX11AO75192 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PEX11AO75192 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX11AO75192 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX11AO75192 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX11AO75192 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX11AO75192 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX11AO75192 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX11AO75192 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX11AO75192 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX11AO75192 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX11AO75192 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX11AO75192 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX11AO75192 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX11AO75192 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX11AO75192 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX11AO75192 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEX11AO75192 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEX11AO75192 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEX11AO75192 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEX11AO75192 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEX11AO75192 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEX11AO75192 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEX11AO75192 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PEX11AO75192 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PEX11AO75192 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PEX11AO75192 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PEX11AO75192 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PEX11AO75192 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms