Protein–RNA interactions for Protein: O75044

SRGAP2, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,071 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2O75044 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRGAP2O75044 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRGAP2O75044 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRGAP2O75044 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRGAP2O75044 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRGAP2O75044 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRGAP2O75044 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRGAP2O75044 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRGAP2O75044 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRGAP2O75044 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRGAP2O75044 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRGAP2O75044 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRGAP2O75044 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRGAP2O75044 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRGAP2O75044 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRGAP2O75044 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRGAP2O75044 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRGAP2O75044 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRGAP2O75044 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRGAP2O75044 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SRGAP2O75044 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRGAP2O75044 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRGAP2O75044 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRGAP2O75044 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRGAP2O75044 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRGAP2O75044 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRGAP2O75044 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRGAP2O75044 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRGAP2O75044 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRGAP2O75044 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRGAP2O75044 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRGAP2O75044 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRGAP2O75044 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRGAP2O75044 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRGAP2O75044 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRGAP2O75044 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SRGAP2O75044 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRGAP2O75044 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRGAP2O75044 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP2O75044 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP2O75044 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP2O75044 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP2O75044 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms