Protein–RNA interactions for Protein: O60936

NOL3, Nucleolar protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOL3O60936 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NOL3O60936 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NOL3O60936 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NOL3O60936 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NOL3O60936 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NOL3O60936 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NOL3O60936 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NOL3O60936 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NOL3O60936 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NOL3O60936 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NOL3O60936 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NOL3O60936 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NOL3O60936 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NOL3O60936 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NOL3O60936 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NOL3O60936 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NOL3O60936 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NOL3O60936 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NOL3O60936 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOL3O60936 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NOL3O60936 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOL3O60936 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOL3O60936 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOL3O60936 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOL3O60936 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOL3O60936 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOL3O60936 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOL3O60936 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOL3O60936 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOL3O60936 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOL3O60936 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOL3O60936 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOL3O60936 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NOL3O60936 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOL3O60936 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOL3O60936 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOL3O60936 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOL3O60936 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOL3O60936 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOL3O60936 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOL3O60936 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NOL3O60936 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOL3O60936 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOL3O60936 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOL3O60936 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOL3O60936 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOL3O60936 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOL3O60936 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOL3O60936 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOL3O60936 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NOL3O60936 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOL3O60936 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOL3O60936 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOL3O60936 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOL3O60936 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOL3O60936 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOL3O60936 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOL3O60936 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOL3O60936 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOL3O60936 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NOL3O60936 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NOL3O60936 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NOL3O60936 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NOL3O60936 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NOL3O60936 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NOL3O60936 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NOL3O60936 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NOL3O60936 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NOL3O60936 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NOL3O60936 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NOL3O60936 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NOL3O60936 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NOL3O60936 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NOL3O60936 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NOL3O60936 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NOL3O60936 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NOL3O60936 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NOL3O60936 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NOL3O60936 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NOL3O60936 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NOL3O60936 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NOL3O60936 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NOL3O60936 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NOL3O60936 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NOL3O60936 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NOL3O60936 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NOL3O60936 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NOL3O60936 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NOL3O60936 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NOL3O60936 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NOL3O60936 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NOL3O60936 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NOL3O60936 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NOL3O60936 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NOL3O60936 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NOL3O60936 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NOL3O60936 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NOL3O60936 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NOL3O60936 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NOL3O60936 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms