Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSVO60911 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSVO60911 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSVO60911 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSVO60911 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSVO60911 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSVO60911 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSVO60911 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSVO60911 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSVO60911 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSVO60911 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSVO60911 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSVO60911 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSVO60911 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSVO60911 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSVO60911 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSVO60911 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSVO60911 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSVO60911 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSVO60911 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSVO60911 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSVO60911 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSVO60911 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSVO60911 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSVO60911 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSVO60911 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSVO60911 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSVO60911 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTSVO60911 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTSVO60911 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTSVO60911 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSVO60911 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSVO60911 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSVO60911 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSVO60911 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSVO60911 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSVO60911 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSVO60911 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSVO60911 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSVO60911 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSVO60911 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSVO60911 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSVO60911 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSVO60911 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSVO60911 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSVO60911 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSVO60911 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSVO60911 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSVO60911 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSVO60911 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSVO60911 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSVO60911 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSVO60911 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSVO60911 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSVO60911 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSVO60911 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSVO60911 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSVO60911 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSVO60911 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSVO60911 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSVO60911 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSVO60911 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSVO60911 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSVO60911 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSVO60911 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSVO60911 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSVO60911 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSVO60911 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSVO60911 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSVO60911 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSVO60911 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSVO60911 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSVO60911 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSVO60911 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSVO60911 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSVO60911 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSVO60911 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSVO60911 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSVO60911 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSVO60911 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSVO60911 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSVO60911 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSVO60911 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSVO60911 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSVO60911 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSVO60911 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSVO60911 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSVO60911 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSVO60911 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTSVO60911 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTSVO60911 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTSVO60911 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTSVO60911 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTSVO60911 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTSVO60911 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTSVO60911 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTSVO60911 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSVO60911 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSVO60911 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSVO60911 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms