Protein–RNA interactions for Protein: O60664

PLIN3, Perilipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN3O60664 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PLIN3O60664 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PLIN3O60664 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLIN3O60664 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PLIN3O60664 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLIN3O60664 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLIN3O60664 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLIN3O60664 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLIN3O60664 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLIN3O60664 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLIN3O60664 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLIN3O60664 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLIN3O60664 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLIN3O60664 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PLIN3O60664 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PLIN3O60664 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PLIN3O60664 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLIN3O60664 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLIN3O60664 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLIN3O60664 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLIN3O60664 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLIN3O60664 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLIN3O60664 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLIN3O60664 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLIN3O60664 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PLIN3O60664 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLIN3O60664 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLIN3O60664 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLIN3O60664 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLIN3O60664 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLIN3O60664 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLIN3O60664 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLIN3O60664 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLIN3O60664 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLIN3O60664 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLIN3O60664 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLIN3O60664 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLIN3O60664 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLIN3O60664 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PLIN3O60664 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLIN3O60664 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLIN3O60664 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLIN3O60664 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLIN3O60664 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLIN3O60664 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLIN3O60664 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLIN3O60664 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PLIN3O60664 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLIN3O60664 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLIN3O60664 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLIN3O60664 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLIN3O60664 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLIN3O60664 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLIN3O60664 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLIN3O60664 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLIN3O60664 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLIN3O60664 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLIN3O60664 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLIN3O60664 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLIN3O60664 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLIN3O60664 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PLIN3O60664 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLIN3O60664 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLIN3O60664 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLIN3O60664 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PLIN3O60664 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLIN3O60664 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLIN3O60664 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLIN3O60664 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLIN3O60664 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLIN3O60664 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLIN3O60664 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLIN3O60664 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLIN3O60664 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLIN3O60664 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLIN3O60664 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLIN3O60664 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLIN3O60664 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLIN3O60664 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLIN3O60664 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLIN3O60664 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLIN3O60664 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLIN3O60664 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLIN3O60664 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLIN3O60664 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PLIN3O60664 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLIN3O60664 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLIN3O60664 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms