Protein–RNA interactions for Protein: O60662

KLHL41, Kelch-like protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL41O60662 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL41O60662 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL41O60662 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL41O60662 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL41O60662 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL41O60662 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL41O60662 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL41O60662 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL41O60662 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL41O60662 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL41O60662 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL41O60662 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL41O60662 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL41O60662 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL41O60662 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL41O60662 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL41O60662 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL41O60662 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL41O60662 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL41O60662 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL41O60662 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL41O60662 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL41O60662 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL41O60662 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL41O60662 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL41O60662 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL41O60662 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL41O60662 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL41O60662 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL41O60662 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL41O60662 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL41O60662 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL41O60662 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL41O60662 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL41O60662 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL41O60662 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL41O60662 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL41O60662 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL41O60662 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL41O60662 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL41O60662 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL41O60662 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL41O60662 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL41O60662 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL41O60662 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL41O60662 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL41O60662 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL41O60662 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL41O60662 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL41O60662 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL41O60662 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL41O60662 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL41O60662 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL41O60662 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL41O60662 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL41O60662 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL41O60662 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL41O60662 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL41O60662 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL41O60662 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL41O60662 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL41O60662 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL41O60662 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL41O60662 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL41O60662 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL41O60662 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL41O60662 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL41O60662 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL41O60662 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL41O60662 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL41O60662 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL41O60662 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL41O60662 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL41O60662 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL41O60662 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL41O60662 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL41O60662 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL41O60662 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL41O60662 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL41O60662 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL41O60662 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL41O60662 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL41O60662 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLHL41O60662 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms