Protein–RNA interactions for Protein: O60494

CUBN, Cubilin, humanhuman

Predictions only

Length 3,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUBNO60494 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUBNO60494 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CUBNO60494 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUBNO60494 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUBNO60494 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUBNO60494 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUBNO60494 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUBNO60494 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUBNO60494 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUBNO60494 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUBNO60494 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUBNO60494 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUBNO60494 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUBNO60494 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUBNO60494 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUBNO60494 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUBNO60494 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CUBNO60494 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUBNO60494 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CUBNO60494 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUBNO60494 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUBNO60494 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUBNO60494 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CUBNO60494 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUBNO60494 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUBNO60494 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUBNO60494 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUBNO60494 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CUBNO60494 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUBNO60494 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUBNO60494 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CUBNO60494 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CUBNO60494 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CUBNO60494 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CUBNO60494 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUBNO60494 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUBNO60494 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUBNO60494 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUBNO60494 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUBNO60494 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUBNO60494 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUBNO60494 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUBNO60494 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUBNO60494 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUBNO60494 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUBNO60494 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUBNO60494 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUBNO60494 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUBNO60494 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUBNO60494 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUBNO60494 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUBNO60494 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUBNO60494 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUBNO60494 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUBNO60494 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUBNO60494 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUBNO60494 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUBNO60494 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CUBNO60494 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUBNO60494 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUBNO60494 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUBNO60494 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUBNO60494 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUBNO60494 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUBNO60494 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUBNO60494 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CUBNO60494 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUBNO60494 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUBNO60494 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUBNO60494 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUBNO60494 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUBNO60494 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUBNO60494 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUBNO60494 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUBNO60494 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUBNO60494 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUBNO60494 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUBNO60494 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUBNO60494 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUBNO60494 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CUBNO60494 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CUBNO60494 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CUBNO60494 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CUBNO60494 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CUBNO60494 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CUBNO60494 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUBNO60494 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUBNO60494 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUBNO60494 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUBNO60494 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUBNO60494 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUBNO60494 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUBNO60494 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUBNO60494 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUBNO60494 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUBNO60494 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUBNO60494 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUBNO60494 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUBNO60494 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUBNO60494 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms