Protein–RNA interactions for Protein: O60248

SOX15, Protein SOX-15, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX15O60248 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOX15O60248 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOX15O60248 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOX15O60248 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SOX15O60248 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SOX15O60248 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SOX15O60248 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SOX15O60248 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SOX15O60248 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SOX15O60248 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SOX15O60248 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SOX15O60248 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SOX15O60248 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SOX15O60248 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SOX15O60248 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SOX15O60248 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SOX15O60248 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SOX15O60248 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SOX15O60248 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SOX15O60248 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SOX15O60248 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX15O60248 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX15O60248 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX15O60248 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX15O60248 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX15O60248 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX15O60248 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX15O60248 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX15O60248 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX15O60248 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX15O60248 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SOX15O60248 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SOX15O60248 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SOX15O60248 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SOX15O60248 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SOX15O60248 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SOX15O60248 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SOX15O60248 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SOX15O60248 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOX15O60248 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOX15O60248 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOX15O60248 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SOX15O60248 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOX15O60248 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOX15O60248 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOX15O60248 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOX15O60248 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOX15O60248 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SOX15O60248 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOX15O60248 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOX15O60248 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOX15O60248 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOX15O60248 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOX15O60248 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOX15O60248 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOX15O60248 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOX15O60248 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOX15O60248 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOX15O60248 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOX15O60248 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SOX15O60248 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOX15O60248 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOX15O60248 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SOX15O60248 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOX15O60248 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SOX15O60248 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOX15O60248 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOX15O60248 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOX15O60248 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOX15O60248 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOX15O60248 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SOX15O60248 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOX15O60248 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOX15O60248 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOX15O60248 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOX15O60248 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SOX15O60248 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SOX15O60248 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SOX15O60248 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SOX15O60248 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SOX15O60248 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SOX15O60248 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SOX15O60248 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SOX15O60248 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SOX15O60248 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SOX15O60248 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SOX15O60248 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SOX15O60248 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SOX15O60248 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SOX15O60248 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SOX15O60248 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SOX15O60248 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SOX15O60248 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
SOX15O60248 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SOX15O60248 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SOX15O60248 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SOX15O60248 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SOX15O60248 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SOX15O60248 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SOX15O60248 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.1 ms