Protein–RNA interactions for Protein: O60239

SH3BP5, SH3 domain-binding protein 5, humanhuman

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Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5O60239 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SH3BP5O60239 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3BP5O60239 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3BP5O60239 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3BP5O60239 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3BP5O60239 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3BP5O60239 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3BP5O60239 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3BP5O60239 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3BP5O60239 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3BP5O60239 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3BP5O60239 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3BP5O60239 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3BP5O60239 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3BP5O60239 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3BP5O60239 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3BP5O60239 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH3BP5O60239 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH3BP5O60239 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SH3BP5O60239 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH3BP5O60239 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH3BP5O60239 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH3BP5O60239 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3BP5O60239 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3BP5O60239 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3BP5O60239 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3BP5O60239 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3BP5O60239 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3BP5O60239 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3BP5O60239 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3BP5O60239 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3BP5O60239 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3BP5O60239 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3BP5O60239 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5O60239 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5O60239 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5O60239 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5O60239 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3BP5O60239 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3BP5O60239 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3BP5O60239 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3BP5O60239 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3BP5O60239 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3BP5O60239 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3BP5O60239 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3BP5O60239 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3BP5O60239 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5O60239 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5O60239 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5O60239 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5O60239 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5O60239 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5O60239 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5O60239 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5O60239 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5O60239 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3BP5O60239 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3BP5O60239 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3BP5O60239 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3BP5O60239 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3BP5O60239 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3BP5O60239 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3BP5O60239 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3BP5O60239 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3BP5O60239 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3BP5O60239 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3BP5O60239 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3BP5O60239 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3BP5O60239 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3BP5O60239 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3BP5O60239 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3BP5O60239 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3BP5O60239 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3BP5O60239 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3BP5O60239 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3BP5O60239 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3BP5O60239 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3BP5O60239 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3BP5O60239 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3BP5O60239 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3BP5O60239 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3BP5O60239 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3BP5O60239 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3BP5O60239 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3BP5O60239 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3BP5O60239 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3BP5O60239 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3BP5O60239 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3BP5O60239 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3BP5O60239 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3BP5O60239 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3BP5O60239 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3BP5O60239 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3BP5O60239 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3BP5O60239 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3BP5O60239 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3BP5O60239 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3BP5O60239 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3BP5O60239 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3BP5O60239 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
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