Protein–RNA interactions for Protein: O43929

ORC4, Origin recognition complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ORC4O43929 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ORC4O43929 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ORC4O43929 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ORC4O43929 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ORC4O43929 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ORC4O43929 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ORC4O43929 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ORC4O43929 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ORC4O43929 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ORC4O43929 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ORC4O43929 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ORC4O43929 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ORC4O43929 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ORC4O43929 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ORC4O43929 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ORC4O43929 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ORC4O43929 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ORC4O43929 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ORC4O43929 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ORC4O43929 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ORC4O43929 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ORC4O43929 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ORC4O43929 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ORC4O43929 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ORC4O43929 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ORC4O43929 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ORC4O43929 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ORC4O43929 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ORC4O43929 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ORC4O43929 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ORC4O43929 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ORC4O43929 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ORC4O43929 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ORC4O43929 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ORC4O43929 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ORC4O43929 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ORC4O43929 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ORC4O43929 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ORC4O43929 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ORC4O43929 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ORC4O43929 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ORC4O43929 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ORC4O43929 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ORC4O43929 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ORC4O43929 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ORC4O43929 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ORC4O43929 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ORC4O43929 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ORC4O43929 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ORC4O43929 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ORC4O43929 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ORC4O43929 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ORC4O43929 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ORC4O43929 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ORC4O43929 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ORC4O43929 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ORC4O43929 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
ORC4O43929 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ORC4O43929 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ORC4O43929 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ORC4O43929 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ORC4O43929 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ORC4O43929 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ORC4O43929 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ORC4O43929 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ORC4O43929 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ORC4O43929 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ORC4O43929 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ORC4O43929 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ORC4O43929 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ORC4O43929 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ORC4O43929 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ORC4O43929 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ORC4O43929 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ORC4O43929 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ORC4O43929 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ORC4O43929 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ORC4O43929 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ORC4O43929 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ORC4O43929 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ORC4O43929 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ORC4O43929 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ORC4O43929 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ORC4O43929 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ORC4O43929 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ORC4O43929 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ORC4O43929 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ORC4O43929 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ORC4O43929 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ORC4O43929 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ORC4O43929 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ORC4O43929 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ORC4O43929 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ORC4O43929 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ORC4O43929 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ORC4O43929 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ORC4O43929 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ORC4O43929 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ORC4O43929 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ORC4O43929 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms