Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CYTH3O43739 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYTH3O43739 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYTH3O43739 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CYTH3O43739 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYTH3O43739 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CYTH3O43739 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CYTH3O43739 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYTH3O43739 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYTH3O43739 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYTH3O43739 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CYTH3O43739 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CYTH3O43739 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CYTH3O43739 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CYTH3O43739 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CYTH3O43739 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CYTH3O43739 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CYTH3O43739 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CYTH3O43739 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CYTH3O43739 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CYTH3O43739 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CYTH3O43739 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYTH3O43739 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYTH3O43739 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYTH3O43739 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYTH3O43739 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYTH3O43739 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYTH3O43739 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYTH3O43739 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYTH3O43739 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYTH3O43739 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CYTH3O43739 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CYTH3O43739 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CYTH3O43739 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CYTH3O43739 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CYTH3O43739 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CYTH3O43739 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYTH3O43739 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYTH3O43739 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYTH3O43739 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CYTH3O43739 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CYTH3O43739 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CYTH3O43739 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CYTH3O43739 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CYTH3O43739 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CYTH3O43739 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CYTH3O43739 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CYTH3O43739 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CYTH3O43739 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CYTH3O43739 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CYTH3O43739 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CYTH3O43739 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CYTH3O43739 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYTH3O43739 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYTH3O43739 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYTH3O43739 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYTH3O43739 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYTH3O43739 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CYTH3O43739 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CYTH3O43739 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CYTH3O43739 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYTH3O43739 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYTH3O43739 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYTH3O43739 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYTH3O43739 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYTH3O43739 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYTH3O43739 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CYTH3O43739 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYTH3O43739 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYTH3O43739 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYTH3O43739 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CYTH3O43739 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CYTH3O43739 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CYTH3O43739 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CYTH3O43739 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CYTH3O43739 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CYTH3O43739 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CYTH3O43739 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CYTH3O43739 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CYTH3O43739 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CYTH3O43739 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CYTH3O43739 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CYTH3O43739 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYTH3O43739 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYTH3O43739 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYTH3O43739 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYTH3O43739 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYTH3O43739 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYTH3O43739 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYTH3O43739 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYTH3O43739 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYTH3O43739 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYTH3O43739 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYTH3O43739 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYTH3O43739 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYTH3O43739 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYTH3O43739 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYTH3O43739 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYTH3O43739 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYTH3O43739 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.3 ms