Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF1O43189 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF1O43189 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF1O43189 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF1O43189 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF1O43189 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF1O43189 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF1O43189 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF1O43189 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF1O43189 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF1O43189 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF1O43189 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF1O43189 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF1O43189 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF1O43189 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF1O43189 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF1O43189 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF1O43189 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF1O43189 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF1O43189 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF1O43189 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF1O43189 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF1O43189 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF1O43189 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF1O43189 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PHF1O43189 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHF1O43189 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHF1O43189 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHF1O43189 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHF1O43189 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHF1O43189 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHF1O43189 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHF1O43189 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHF1O43189 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHF1O43189 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF1O43189 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF1O43189 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF1O43189 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF1O43189 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF1O43189 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF1O43189 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF1O43189 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF1O43189 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF1O43189 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF1O43189 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF1O43189 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF1O43189 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF1O43189 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF1O43189 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF1O43189 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHF1O43189 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHF1O43189 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHF1O43189 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHF1O43189 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHF1O43189 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHF1O43189 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHF1O43189 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHF1O43189 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHF1O43189 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PHF1O43189 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHF1O43189 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHF1O43189 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF1O43189 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF1O43189 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF1O43189 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF1O43189 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF1O43189 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHF1O43189 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHF1O43189 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHF1O43189 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHF1O43189 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHF1O43189 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHF1O43189 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF1O43189 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF1O43189 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF1O43189 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF1O43189 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF1O43189 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF1O43189 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF1O43189 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF1O43189 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF1O43189 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF1O43189 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF1O43189 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF1O43189 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF1O43189 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF1O43189 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF1O43189 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF1O43189 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF1O43189 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF1O43189 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF1O43189 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF1O43189 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF1O43189 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF1O43189 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF1O43189 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF1O43189 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF1O43189 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF1O43189 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF1O43189 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms