Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 LZTR1-210ENST00000464807 566 ntTSL 212.96□□□□□ -0.332e-9■■■■■ 28.7
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PRPF4O43172 EIF6-205ENST00000440766 798 ntTSL 215.47■□□□□ 0.076e-43■■■■■ 28.6
PRPF4O43172 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 28.6
PRPF4O43172 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.652e-6■■■■■ 28.6
PRPF4O43172 FOXP4-206ENST00000451305 367 ntTSL 1 (best)16.47■□□□□ 0.233e-8■■■■■ 28.6
PRPF4O43172 RPLP2-202ENST00000524867 598 ntTSL 224.14■■□□□ 1.452e-8■■■■■ 28.6
PRPF4O43172 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.194e-7■■■■■ 28.6
PRPF4O43172 CLN6-224ENST00000638076 2323 ntTSL 1 (best)22.36■■□□□ 1.174e-7■■■■■ 28.6
PRPF4O43172 TOLLIP-204ENST00000527085 595 ntTSL 521.48■■□□□ 1.032e-8■■■■■ 28.6
PRPF4O43172 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.942e-8■■■■■ 28.6
PRPF4O43172 COPE-208ENST00000598969 1770 ntTSL 520.82■□□□□ 0.922e-8■■■■■ 28.6
PRPF4O43172 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.862e-8■■■■■ 28.6
PRPF4O43172 RECQL4-206ENST00000534270 517 ntTSL 320.36■□□□□ 0.852e-8■■■■■ 28.6
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PRPF4O43172 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.674e-7■■■■■ 28.6
PRPF4O43172 COPE-204ENST00000593827 601 ntTSL 319.2■□□□□ 0.662e-8■■■■■ 28.6
PRPF4O43172 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.624e-7■■■■■ 28.6
PRPF4O43172 POLRMT-208ENST00000592863 966 ntTSL 518.93■□□□□ 0.622e-8■■■■■ 28.6
PRPF4O43172 RECQL4-202ENST00000524998 686 ntTSL 318.84■□□□□ 0.612e-8■■■■■ 28.6
PRPF4O43172 SEC63-203ENST00000446496 583 ntTSL 417.86■□□□□ 0.452e-8■■■■■ 28.6
PRPF4O43172 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.422e-8■■■■■ 28.6
PRPF4O43172 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.392e-8■■■■■ 28.6
PRPF4O43172 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.324e-7■■■■■ 28.6
PRPF4O43172 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.292e-8■■■■■ 28.6
PRPF4O43172 RECQL4-207ENST00000534538 725 ntTSL 316.82■□□□□ 0.282e-8■■■■■ 28.6
PRPF4O43172 MIDN-204ENST00000590136 536 ntTSL 216.6■□□□□ 0.252e-8■■■■■ 28.6
PRPF4O43172 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.242e-8■■■■■ 28.6
PRPF4O43172 CLN6-208ENST00000567060 945 ntTSL 216.02■□□□□ 0.164e-7■■■■■ 28.6
PRPF4O43172 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.122e-8■■■■■ 28.6
PRPF4O43172 CLN6-219ENST00000637329 1204 ntTSL 515.4■□□□□ 0.064e-7■■■■■ 28.6
PRPF4O43172 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.022e-8■■■■■ 28.6
PRPF4O43172 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.032e-8■■■■■ 28.6
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PRPF4O43172 SEC63-202ENST00000429168 647 ntTSL 56.02□□□□□ -1.452e-8■■■■■ 28.6
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PRPF4O43172 FKBP2-206ENST00000541388 705 ntTSL 518.03■□□□□ 0.482e-7■■■■■ 28.6
PRPF4O43172 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.062e-7■■■■■ 28.6
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PRPF4O43172 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.897e-10■■■■■ 28.5
PRPF4O43172 CPSF1-202ENST00000527827 619 ntTSL 222.37■■□□□ 1.171e-7■■■■■ 28.5
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PRPF4O43172 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.544e-9■■■■■ 28.5
PRPF4O43172 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.26e-7■■■■■ 28.5
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PRPF4O43172 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.16e-7■■■■■ 28.5
PRPF4O43172 FBXO16-210ENST00000521548 2983 ntTSL 214.14□□□□□ -0.156e-7■■■■■ 28.5
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PRPF4O43172 APOC1-208ENST00000592535 430 ntTSL 1 (best)13.19□□□□□ -0.31e-8■■■■■ 28.4
PRPF4O43172 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.381e-8■■■■■ 28.4
PRPF4O43172 APOC1-206ENST00000590334 508 ntTSL 511.66□□□□□ -0.541e-8■■■■■ 28.4
PRPF4O43172 APOC1-203ENST00000588802 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.771e-8■■■■■ 28.4
PRPF4O43172 APOC1-205ENST00000589781 273 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.771e-8■■■■■ 28.4
PRPF4O43172 APOC1-201ENST00000586638 425 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.771e-8■■■■■ 28.4
PRPF4O43172 APOC1-204ENST00000589078 213 ntTSL 29.23□□□□□ -0.931e-8■■■■■ 28.4
PRPF4O43172 APOC1-207ENST00000592176 514 ntTSL 58.72□□□□□ -1.011e-8■■■■■ 28.4
PRPF4O43172 APOC1-202ENST00000588750 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.151e-8■■■■■ 28.4
PRPF4O43172 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.233e-7■■■■■ 28.4
PRPF4O43172 SPATA2L-203ENST00000569918 692 ntTSL 219.7■□□□□ 0.743e-7■■■■■ 28.4
PRPF4O43172 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.63e-7■■■■■ 28.4
PRPF4O43172 CNOT1-206ENST00000564557 582 ntTSL 313.06□□□□□ -0.325e-14■■■■■ 28.4
PRPF4O43172 CNOT1-215ENST00000569020 535 ntTSL 413.03□□□□□ -0.325e-14■■■■■ 28.4
PRPF4O43172 CNOT1-217ENST00000569263 304 ntTSL 212.45□□□□□ -0.425e-14■■■■■ 28.4
PRPF4O43172 CNOT1-220ENST00000569916 599 ntTSL 312.38□□□□□ -0.435e-14■■■■■ 28.4
PRPF4O43172 CNOT1-213ENST00000568158 496 ntTSL 312.31□□□□□ -0.445e-14■■■■■ 28.4
PRPF4O43172 CNOT1-207ENST00000565605 739 ntTSL 49.17□□□□□ -0.945e-14■■■■■ 28.4
PRPF4O43172 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.235e-14■■■■■ 28.4
PRPF4O43172 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.355e-14■■■■■ 28.4
PRPF4O43172 CNOT1-211ENST00000567188 7830 ntTSL 1 (best)5.97□□□□□ -1.455e-14■■■■■ 28.4
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