Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLXNB1O43157 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLXNB1O43157 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms