Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MEFVO15553 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MEFVO15553 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MEFVO15553 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MEFVO15553 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MEFVO15553 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MEFVO15553 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MEFVO15553 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MEFVO15553 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MEFVO15553 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MEFVO15553 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MEFVO15553 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MEFVO15553 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MEFVO15553 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MEFVO15553 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MEFVO15553 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MEFVO15553 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MEFVO15553 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MEFVO15553 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MEFVO15553 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MEFVO15553 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MEFVO15553 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MEFVO15553 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MEFVO15553 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MEFVO15553 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MEFVO15553 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MEFVO15553 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MEFVO15553 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MEFVO15553 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MEFVO15553 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MEFVO15553 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MEFVO15553 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MEFVO15553 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MEFVO15553 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MEFVO15553 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MEFVO15553 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MEFVO15553 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MEFVO15553 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MEFVO15553 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MEFVO15553 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MEFVO15553 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MEFVO15553 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MEFVO15553 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MEFVO15553 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MEFVO15553 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MEFVO15553 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MEFVO15553 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MEFVO15553 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MEFVO15553 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MEFVO15553 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MEFVO15553 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MEFVO15553 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MEFVO15553 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MEFVO15553 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MEFVO15553 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MEFVO15553 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MEFVO15553 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MEFVO15553 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MEFVO15553 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MEFVO15553 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MEFVO15553 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MEFVO15553 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MEFVO15553 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MEFVO15553 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MEFVO15553 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MEFVO15553 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MEFVO15553 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MEFVO15553 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MEFVO15553 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MEFVO15553 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MEFVO15553 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MEFVO15553 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MEFVO15553 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MEFVO15553 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MEFVO15553 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MEFVO15553 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MEFVO15553 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MEFVO15553 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
MEFVO15553 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MEFVO15553 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MEFVO15553 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MEFVO15553 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MEFVO15553 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
MEFVO15553 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MEFVO15553 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MEFVO15553 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MEFVO15553 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MEFVO15553 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MEFVO15553 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MEFVO15553 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MEFVO15553 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MEFVO15553 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MEFVO15553 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MEFVO15553 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MEFVO15553 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MEFVO15553 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MEFVO15553 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MEFVO15553 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MEFVO15553 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MEFVO15553 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms