Protein–RNA interactions for Protein: O15522

NKX2-8, Homeobox protein Nkx-2.8, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-8O15522 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX2-8O15522 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX2-8O15522 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX2-8O15522 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKX2-8O15522 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKX2-8O15522 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKX2-8O15522 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKX2-8O15522 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKX2-8O15522 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKX2-8O15522 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKX2-8O15522 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKX2-8O15522 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKX2-8O15522 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKX2-8O15522 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKX2-8O15522 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKX2-8O15522 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKX2-8O15522 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKX2-8O15522 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKX2-8O15522 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKX2-8O15522 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKX2-8O15522 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKX2-8O15522 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKX2-8O15522 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKX2-8O15522 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKX2-8O15522 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKX2-8O15522 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKX2-8O15522 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NKX2-8O15522 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKX2-8O15522 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKX2-8O15522 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKX2-8O15522 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKX2-8O15522 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKX2-8O15522 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKX2-8O15522 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKX2-8O15522 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKX2-8O15522 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NKX2-8O15522 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKX2-8O15522 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKX2-8O15522 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NKX2-8O15522 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NKX2-8O15522 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKX2-8O15522 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKX2-8O15522 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NKX2-8O15522 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NKX2-8O15522 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKX2-8O15522 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NKX2-8O15522 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NKX2-8O15522 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NKX2-8O15522 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKX2-8O15522 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKX2-8O15522 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKX2-8O15522 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKX2-8O15522 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKX2-8O15522 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKX2-8O15522 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKX2-8O15522 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKX2-8O15522 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKX2-8O15522 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKX2-8O15522 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKX2-8O15522 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKX2-8O15522 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKX2-8O15522 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKX2-8O15522 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKX2-8O15522 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NKX2-8O15522 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKX2-8O15522 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKX2-8O15522 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKX2-8O15522 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKX2-8O15522 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKX2-8O15522 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKX2-8O15522 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKX2-8O15522 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKX2-8O15522 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKX2-8O15522 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKX2-8O15522 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKX2-8O15522 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKX2-8O15522 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKX2-8O15522 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKX2-8O15522 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKX2-8O15522 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NKX2-8O15522 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKX2-8O15522 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKX2-8O15522 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKX2-8O15522 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKX2-8O15522 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKX2-8O15522 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKX2-8O15522 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKX2-8O15522 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKX2-8O15522 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NKX2-8O15522 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKX2-8O15522 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKX2-8O15522 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKX2-8O15522 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKX2-8O15522 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKX2-8O15522 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKX2-8O15522 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKX2-8O15522 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKX2-8O15522 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKX2-8O15522 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKX2-8O15522 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms