Protein–RNA interactions for Protein: O15514

POLR2D, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2DO15514 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLR2DO15514 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLR2DO15514 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLR2DO15514 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR2DO15514 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR2DO15514 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR2DO15514 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR2DO15514 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR2DO15514 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR2DO15514 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR2DO15514 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR2DO15514 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLR2DO15514 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLR2DO15514 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLR2DO15514 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR2DO15514 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR2DO15514 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR2DO15514 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
POLR2DO15514 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
POLR2DO15514 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR2DO15514 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR2DO15514 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR2DO15514 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR2DO15514 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR2DO15514 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR2DO15514 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR2DO15514 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR2DO15514 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR2DO15514 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR2DO15514 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR2DO15514 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR2DO15514 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR2DO15514 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR2DO15514 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR2DO15514 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR2DO15514 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR2DO15514 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR2DO15514 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR2DO15514 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR2DO15514 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR2DO15514 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR2DO15514 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR2DO15514 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR2DO15514 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR2DO15514 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR2DO15514 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR2DO15514 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR2DO15514 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR2DO15514 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR2DO15514 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR2DO15514 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR2DO15514 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR2DO15514 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR2DO15514 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR2DO15514 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR2DO15514 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR2DO15514 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR2DO15514 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR2DO15514 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR2DO15514 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR2DO15514 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR2DO15514 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR2DO15514 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR2DO15514 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR2DO15514 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR2DO15514 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR2DO15514 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR2DO15514 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR2DO15514 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR2DO15514 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR2DO15514 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR2DO15514 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR2DO15514 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR2DO15514 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR2DO15514 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR2DO15514 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR2DO15514 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR2DO15514 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR2DO15514 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR2DO15514 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR2DO15514 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR2DO15514 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR2DO15514 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR2DO15514 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR2DO15514 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR2DO15514 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR2DO15514 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR2DO15514 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR2DO15514 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR2DO15514 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR2DO15514 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR2DO15514 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR2DO15514 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR2DO15514 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR2DO15514 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR2DO15514 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR2DO15514 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR2DO15514 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR2DO15514 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR2DO15514 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms