Protein–RNA interactions for Protein: O15027

SEC16A, Protein transport protein Sec16A, humanhuman

Predictions only

Length 2,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC16AO15027 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC16AO15027 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC16AO15027 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC16AO15027 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC16AO15027 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC16AO15027 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC16AO15027 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC16AO15027 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC16AO15027 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC16AO15027 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC16AO15027 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC16AO15027 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC16AO15027 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC16AO15027 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC16AO15027 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC16AO15027 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC16AO15027 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC16AO15027 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC16AO15027 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC16AO15027 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC16AO15027 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC16AO15027 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC16AO15027 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC16AO15027 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC16AO15027 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC16AO15027 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC16AO15027 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC16AO15027 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC16AO15027 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC16AO15027 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC16AO15027 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC16AO15027 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC16AO15027 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC16AO15027 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC16AO15027 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC16AO15027 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC16AO15027 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC16AO15027 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC16AO15027 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC16AO15027 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC16AO15027 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC16AO15027 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC16AO15027 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC16AO15027 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC16AO15027 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC16AO15027 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC16AO15027 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC16AO15027 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC16AO15027 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEC16AO15027 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEC16AO15027 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEC16AO15027 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEC16AO15027 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC16AO15027 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC16AO15027 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC16AO15027 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC16AO15027 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC16AO15027 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC16AO15027 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC16AO15027 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC16AO15027 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC16AO15027 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC16AO15027 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC16AO15027 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC16AO15027 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC16AO15027 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC16AO15027 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC16AO15027 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC16AO15027 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC16AO15027 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC16AO15027 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC16AO15027 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC16AO15027 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC16AO15027 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC16AO15027 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC16AO15027 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC16AO15027 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC16AO15027 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC16AO15027 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC16AO15027 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC16AO15027 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC16AO15027 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC16AO15027 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC16AO15027 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC16AO15027 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC16AO15027 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC16AO15027 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC16AO15027 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC16AO15027 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC16AO15027 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC16AO15027 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC16AO15027 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC16AO15027 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC16AO15027 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SEC16AO15027 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SEC16AO15027 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC16AO15027 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC16AO15027 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC16AO15027 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC16AO15027 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms