Protein–RNA interactions for Protein: O00628

PEX7, Peroxisomal targeting signal 2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX7O00628 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PEX7O00628 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PEX7O00628 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PEX7O00628 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PEX7O00628 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PEX7O00628 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PEX7O00628 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PEX7O00628 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PEX7O00628 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PEX7O00628 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PEX7O00628 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PEX7O00628 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PEX7O00628 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PEX7O00628 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PEX7O00628 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PEX7O00628 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PEX7O00628 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PEX7O00628 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PEX7O00628 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PEX7O00628 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PEX7O00628 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PEX7O00628 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PEX7O00628 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PEX7O00628 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PEX7O00628 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PEX7O00628 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PEX7O00628 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PEX7O00628 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PEX7O00628 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PEX7O00628 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PEX7O00628 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PEX7O00628 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PEX7O00628 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PEX7O00628 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PEX7O00628 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PEX7O00628 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PEX7O00628 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX7O00628 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX7O00628 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX7O00628 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX7O00628 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX7O00628 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PEX7O00628 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PEX7O00628 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PEX7O00628 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PEX7O00628 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PEX7O00628 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PEX7O00628 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PEX7O00628 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PEX7O00628 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PEX7O00628 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PEX7O00628 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PEX7O00628 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PEX7O00628 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PEX7O00628 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PEX7O00628 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PEX7O00628 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX7O00628 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX7O00628 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX7O00628 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX7O00628 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX7O00628 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX7O00628 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX7O00628 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX7O00628 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX7O00628 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX7O00628 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX7O00628 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX7O00628 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX7O00628 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX7O00628 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX7O00628 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX7O00628 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX7O00628 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX7O00628 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX7O00628 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX7O00628 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX7O00628 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX7O00628 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX7O00628 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX7O00628 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX7O00628 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX7O00628 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX7O00628 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX7O00628 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX7O00628 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX7O00628 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX7O00628 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX7O00628 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX7O00628 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX7O00628 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX7O00628 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX7O00628 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX7O00628 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PEX7O00628 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PEX7O00628 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PEX7O00628 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PEX7O00628 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PEX7O00628 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PEX7O00628 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.8 ms