Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PIK3CDO00329 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PIK3CDO00329 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PIK3CDO00329 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PIK3CDO00329 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PIK3CDO00329 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIK3CDO00329 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIK3CDO00329 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIK3CDO00329 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIK3CDO00329 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIK3CDO00329 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIK3CDO00329 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIK3CDO00329 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIK3CDO00329 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIK3CDO00329 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIK3CDO00329 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIK3CDO00329 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIK3CDO00329 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIK3CDO00329 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIK3CDO00329 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIK3CDO00329 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIK3CDO00329 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIK3CDO00329 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIK3CDO00329 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIK3CDO00329 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIK3CDO00329 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIK3CDO00329 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIK3CDO00329 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PIK3CDO00329 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PIK3CDO00329 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PIK3CDO00329 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PIK3CDO00329 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PIK3CDO00329 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PIK3CDO00329 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PIK3CDO00329 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PIK3CDO00329 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PIK3CDO00329 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PIK3CDO00329 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PIK3CDO00329 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PIK3CDO00329 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PIK3CDO00329 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PIK3CDO00329 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PIK3CDO00329 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PIK3CDO00329 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PIK3CDO00329 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PIK3CDO00329 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PIK3CDO00329 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PIK3CDO00329 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PIK3CDO00329 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PIK3CDO00329 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PIK3CDO00329 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PIK3CDO00329 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PIK3CDO00329 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PIK3CDO00329 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PIK3CDO00329 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PIK3CDO00329 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PIK3CDO00329 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PIK3CDO00329 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PIK3CDO00329 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PIK3CDO00329 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PIK3CDO00329 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PIK3CDO00329 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PIK3CDO00329 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PIK3CDO00329 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PIK3CDO00329 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PIK3CDO00329 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PIK3CDO00329 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PIK3CDO00329 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PIK3CDO00329 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PIK3CDO00329 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PIK3CDO00329 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PIK3CDO00329 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PIK3CDO00329 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PIK3CDO00329 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PIK3CDO00329 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PIK3CDO00329 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PIK3CDO00329 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PIK3CDO00329 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PIK3CDO00329 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PIK3CDO00329 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PIK3CDO00329 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PIK3CDO00329 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PIK3CDO00329 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PIK3CDO00329 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PIK3CDO00329 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PIK3CDO00329 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PIK3CDO00329 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIK3CDO00329 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIK3CDO00329 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIK3CDO00329 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PIK3CDO00329 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIK3CDO00329 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIK3CDO00329 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIK3CDO00329 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIK3CDO00329 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIK3CDO00329 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIK3CDO00329 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIK3CDO00329 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PIK3CDO00329 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PIK3CDO00329 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms