Protein–RNA interactions for Protein: O00192

ARVCF, Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome, humanhuman

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARVCFO00192 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ARVCFO00192 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARVCFO00192 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARVCFO00192 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARVCFO00192 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARVCFO00192 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARVCFO00192 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARVCFO00192 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARVCFO00192 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARVCFO00192 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARVCFO00192 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARVCFO00192 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARVCFO00192 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARVCFO00192 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARVCFO00192 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARVCFO00192 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARVCFO00192 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARVCFO00192 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARVCFO00192 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARVCFO00192 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARVCFO00192 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARVCFO00192 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARVCFO00192 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARVCFO00192 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARVCFO00192 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARVCFO00192 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARVCFO00192 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARVCFO00192 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARVCFO00192 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARVCFO00192 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARVCFO00192 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARVCFO00192 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARVCFO00192 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARVCFO00192 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARVCFO00192 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARVCFO00192 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARVCFO00192 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ARVCFO00192 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARVCFO00192 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARVCFO00192 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARVCFO00192 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARVCFO00192 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARVCFO00192 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARVCFO00192 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ARVCFO00192 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARVCFO00192 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARVCFO00192 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ARVCFO00192 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ARVCFO00192 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARVCFO00192 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARVCFO00192 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARVCFO00192 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARVCFO00192 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARVCFO00192 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ARVCFO00192 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARVCFO00192 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARVCFO00192 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARVCFO00192 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARVCFO00192 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARVCFO00192 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARVCFO00192 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARVCFO00192 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARVCFO00192 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARVCFO00192 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARVCFO00192 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ARVCFO00192 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARVCFO00192 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARVCFO00192 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARVCFO00192 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ARVCFO00192 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARVCFO00192 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARVCFO00192 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARVCFO00192 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARVCFO00192 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARVCFO00192 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARVCFO00192 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARVCFO00192 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ARVCFO00192 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARVCFO00192 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARVCFO00192 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARVCFO00192 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARVCFO00192 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARVCFO00192 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARVCFO00192 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ARVCFO00192 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARVCFO00192 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARVCFO00192 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ARVCFO00192 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARVCFO00192 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARVCFO00192 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ARVCFO00192 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARVCFO00192 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARVCFO00192 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ARVCFO00192 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARVCFO00192 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARVCFO00192 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARVCFO00192 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARVCFO00192 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARVCFO00192 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARVCFO00192 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms