Protein–RNA interactions for Protein: H3BMG3

SMKR1, Small lysine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1H3BMG3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMKR1H3BMG3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMKR1H3BMG3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMKR1H3BMG3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMKR1H3BMG3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMKR1H3BMG3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMKR1H3BMG3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMKR1H3BMG3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMKR1H3BMG3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMKR1H3BMG3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMKR1H3BMG3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMKR1H3BMG3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMKR1H3BMG3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMKR1H3BMG3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMKR1H3BMG3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMKR1H3BMG3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SMKR1H3BMG3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMKR1H3BMG3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMKR1H3BMG3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMKR1H3BMG3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMKR1H3BMG3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMKR1H3BMG3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMKR1H3BMG3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMKR1H3BMG3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SMKR1H3BMG3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SMKR1H3BMG3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMKR1H3BMG3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms