Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC35.62■■■■□ 3.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms