Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PATL2C9JE40 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PATL2C9JE40 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PATL2C9JE40 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PATL2C9JE40 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PATL2C9JE40 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PATL2C9JE40 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PATL2C9JE40 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PATL2C9JE40 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PATL2C9JE40 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PATL2C9JE40 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PATL2C9JE40 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PATL2C9JE40 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PATL2C9JE40 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PATL2C9JE40 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PATL2C9JE40 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PATL2C9JE40 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PATL2C9JE40 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PATL2C9JE40 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PATL2C9JE40 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PATL2C9JE40 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PATL2C9JE40 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PATL2C9JE40 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PATL2C9JE40 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PATL2C9JE40 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PATL2C9JE40 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PATL2C9JE40 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PATL2C9JE40 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PATL2C9JE40 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PATL2C9JE40 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PATL2C9JE40 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PATL2C9JE40 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PATL2C9JE40 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PATL2C9JE40 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PATL2C9JE40 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PATL2C9JE40 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PATL2C9JE40 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PATL2C9JE40 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PATL2C9JE40 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PATL2C9JE40 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PATL2C9JE40 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PATL2C9JE40 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PATL2C9JE40 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PATL2C9JE40 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PATL2C9JE40 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PATL2C9JE40 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PATL2C9JE40 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PATL2C9JE40 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PATL2C9JE40 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PATL2C9JE40 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PATL2C9JE40 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PATL2C9JE40 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PATL2C9JE40 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PATL2C9JE40 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PATL2C9JE40 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PATL2C9JE40 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PATL2C9JE40 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PATL2C9JE40 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PATL2C9JE40 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PATL2C9JE40 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PATL2C9JE40 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PATL2C9JE40 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PATL2C9JE40 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PATL2C9JE40 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PATL2C9JE40 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PATL2C9JE40 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PATL2C9JE40 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PATL2C9JE40 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PATL2C9JE40 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PATL2C9JE40 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PATL2C9JE40 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PATL2C9JE40 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PATL2C9JE40 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PATL2C9JE40 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PATL2C9JE40 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PATL2C9JE40 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PATL2C9JE40 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PATL2C9JE40 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PATL2C9JE40 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PATL2C9JE40 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PATL2C9JE40 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PATL2C9JE40 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PATL2C9JE40 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PATL2C9JE40 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PATL2C9JE40 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PATL2C9JE40 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PATL2C9JE40 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PATL2C9JE40 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PATL2C9JE40 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PATL2C9JE40 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PATL2C9JE40 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PATL2C9JE40 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PATL2C9JE40 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PATL2C9JE40 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PATL2C9JE40 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PATL2C9JE40 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PATL2C9JE40 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PATL2C9JE40 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PATL2C9JE40 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PATL2C9JE40 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms