Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
B4E171 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
B4E171 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
B4E171 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
B4E171 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
B4E171 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
B4E171 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
B4E171 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
B4E171 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
B4E171 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
B4E171 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
B4E171 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
B4E171 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
B4E171 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
B4E171 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
B4E171 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
B4E171 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
B4E171 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
B4E171 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
B4E171 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
B4E171 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
B4E171 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
B4E171 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
B4E171 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
B4E171 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
B4E171 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
B4E171 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
B4E171 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
B4E171 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
B4E171 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
B4E171 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
B4E171 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
B4E171 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
B4E171 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
B4E171 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
B4E171 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
B4E171 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
B4E171 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
B4E171 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
B4E171 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
B4E171 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
B4E171 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
B4E171 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
B4E171 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
B4E171 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
B4E171 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
B4E171 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
B4E171 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
B4E171 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
B4E171 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
B4E171 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
B4E171 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
B4E171 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
B4E171 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
B4E171 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
B4E171 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
B4E171 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
B4E171 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
B4E171 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
B4E171 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
B4E171 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
B4E171 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
B4E171 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
B4E171 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
B4E171 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
B4E171 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
B4E171 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
B4E171 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
B4E171 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
B4E171 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
B4E171 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
B4E171 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
B4E171 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
B4E171 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
B4E171 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
B4E171 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
B4E171 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
B4E171 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
B4E171 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
B4E171 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
B4E171 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
B4E171 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
B4E171 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
B4E171 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
B4E171 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
B4E171 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
B4E171 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
B4E171 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
B4E171 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
B4E171 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
B4E171 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
B4E171 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
B4E171 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
B4E171 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
B4E171 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
B4E171 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
B4E171 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
B4E171 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
B4E171 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
B4E171 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms